RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523636.5

PABPC1-223, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, human

TSL 5

Gene PABPC1, Length 818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PABPC1-223	ENST00000523636	KIF18A	Q8NI77	898 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RAPGEF5	Q92565	580 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM162A	Q96A26	154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RGMA	Q96B86	450 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	EID2B	Q96D98	161 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SIRT3	Q9NTG7	399 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC35D1	Q9NTN3	355 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ATAD3A	Q9NVI7	634 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SUFU	Q9UMX1	484 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636		A0A1B0GVL5	298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ISM1	B1AKI9	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636		H0YCG3	227 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636		H0YIV9	168 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	KRT86	O43790	486 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SPOP	O43791	374 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIM13	O60858	407 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NEBL	O76041	1014 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	DEXI	O95424	95 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NDST3	O95803	873 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GAST	P01350	101 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	INHBA	P08476	426 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PRG2	P13727	222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	JAK1	P23458	1154 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SFN	P31947	248 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PSMB10	P40306	273 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ARCN1	P48444	511 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	JAK3	P52333	1124 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	BCAT1	P54687	386 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SLC7A9	P82251	487 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GUCY1B3	Q02153	619 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GAD2	Q05329	585 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PPP3CA	Q08209	521 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CDC20	Q12834	499 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	BNIP1	Q12981	228 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CHIT1	Q13231	466 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FGL2	Q14314	439 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	BAK1	Q16611	211 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM187B	Q17R55	369 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CCDC142	Q17RM4	750 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MST1L	Q2TV78	715 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CES4A	Q5XG92	561 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	KLC3	Q6P597	504 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SUSD1	Q6UWL2	747 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SPATA24	Q86W54	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NCSTN	Q92542	709 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MR1	Q95460	341 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	IQCD	Q96DY2	449 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CEP170P1	Q96L14	293 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CATSPER2	Q96P56	530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	AGAP2	Q99490	1192 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ABCG8	Q9H221	673 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	DPH5	Q9H2P9	285 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	MUC13	Q9H3R2	512 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	FANCE	Q9HB96	536 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SMPD4	Q9NXE4	827 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	THAP10	Q9P2Z0	257 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	PISD	Q9UG56	409 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	HSF4	Q9ULV5	492 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CPQ	Q9Y646	472 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	CLIC4	Q9Y696	253 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
PABPC1-223	ENST00000523636	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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