RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 SSC4DQ8WTU2 575 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 C1orf54Q8WWF1 131 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ASZ1Q8WWH4 475 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PTERQ96BW5 349 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 MENTQ9BUN1 341 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CARD6Q9BX69 1037 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CASS4Q9NQ75 786 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 RAB6BQ9NRW1 208 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 C5AR2Q9P296 337 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ZNF148Q9UQR1 794 aa16.28■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 KRT86O43790 486 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 GPC4O75487 556 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 UMODP07911 640 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CD9P21926 228 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 ALAS2P22557 587 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PRAMEP78395 509 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SNX1Q13596 522 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 GRB7Q14451 532 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 MYBPC3Q14896 1274 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TAX1BP1Q86VP1 789 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 KRT222Q8N1A0 295 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 C19orf60Q96EN9 201 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 IL17FQ96PD4 163 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TSSK1BQ9BXA7 367 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SLC29A3Q9BZD2 475 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A11Q9NSA0 550 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.27■□□□□ 0.2
HERC3-211ENST00000513325 CCDC88CQ9P219 2028 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 IGHEP01854 428 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 RPN2P04844 631 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 APOA4P06727 396 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 APRTP07741 180 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 RNF224P0DH78 156 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 GRIA3P42263 894 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 TTLL10Q6ZVT0 673 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 NLRP9Q7RTR0 991 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A18Q96BI1 424 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ANAPC5Q9UJX4 755 aa16.26■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ALPPP05187 535 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ITGAXP20702 1163 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 AOAHP28039 575 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 GCGRP47871 477 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SF1Q15637 639 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CYP2A13Q16696 494 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 UNC5DQ6UXZ4 953 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 IQCKQ8N0W5 287 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CCDC89Q8N998 374 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PRR7Q8TB68 274 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 DLG3Q92796 817 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PEX13Q92968 403 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CHRAC1Q9NRG0 131 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CATSPERZQ9NTU4 200 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ASF1BQ9NVP2 202 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ESPL1Q14674 2120 aa16.25■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 RASGRF2O14827 1237 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 KLHL41O60662 606 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SLCO2B1O94956 709 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 S1PR4O95977 384 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 MCM3P25205 808 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ARSFP54793 590 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 SOX8P57073 446 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 FCRL6Q6DN72 434 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 IGFL3Q6UXB1 125 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 PAK5Q9P286 719 aa16.24■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 ICE1Q9Y2F5 2266 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GX78 115 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 AGPSO00116 658 aa16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 RPL22P35268 128 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HERC3-211ENST00000513325 TTPAP49638 278 aa16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms