RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 MYO1CO00159 1063 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 HCRTR1O43613 425 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 VPS26AO75436 327 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 SPAG6O75602 509 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 STK17BO94768 372 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TSPAN12O95859 305 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CTAGE8P0CG41 777 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 MPC1LP0DKB6 136 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CBSLP0DN79 551 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ERGP11308 486 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 FDXRP22570 491 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CBSP35520 551 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CCNFP41002 786 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 MAGEA4P43358 317 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TUBB3Q13509 450 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 GPR19Q15760 415 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CYP2A13Q16696 494 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CTAGE6Q86UF2 777 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CTAGE4Q8IX94 777 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 PALM2Q8IXS6 379 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 MNS1Q8NEH6 495 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 HMGCLL1Q8TB92 370 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 FOPNLQ96NB1 174 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 PKP4Q99569 1192 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CPNE5Q9HCH3 593 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ZFATQ9P243 1243 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 VWA7Q9Y334 891 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CHD6Q8TD26 2715 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM159BA6NKW6 160 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ISM1B1AKI9 464 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 KDM1AO60341 852 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 RAD1O60671 282 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 MSL3P1P0C860 447 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 GABRA4P48169 554 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ARL4DP49703 201 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TUBB4BP68371 445 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ACY1Q03154 408 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC5A12Q1EHB4 618 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TTC23LQ6PF05 361 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM207Q6UWW9 146 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 STRA8Q7Z7C7 330 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 VASH2Q86V25 355 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC26A11Q86WA9 606 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC25Q86WR0 208 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP1R3BQ86XI6 285 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 GPATCH11Q8N954 259 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 OR9A1PQ8NGU1 263 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 PDE7BQ9NP56 450 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 KLHL20Q9Y2M5 609 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.66□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A0J9YY10 115 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 H3BMH7 237 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CTSBP07858 339 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 GSTA2P09210 222 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ECHS1P30084 290 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 YBX1P67809 324 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 TMTC4Q5T4D3 741 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 OR2A1Q8NGT9 310 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 OR1L3Q8NH93 324 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 FCRL4Q96PJ5 515 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ULBP3Q9BZM4 244 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 SOHLH2Q9NX45 425 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 SPATA7Q9P0W8 599 aa14.65□□□□□ -0.06
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms