RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	COPZ1	P61923	177 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	GHRHR	Q02643	423 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TEAD4	Q15561	434 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PIGG	Q5H8A4	983 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PIK3R6	Q5UE93	754 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SMYD1	Q8NB12	490 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR5AK3P	Q8NH89	298 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FAM110B	Q8TC76	370 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CMTM6	Q9NX76	183 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	EMCN	Q9ULC0	261 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		7.88	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GW55	424 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193		M0QX08	132 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	GJB5	O95377	273 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	GBA	P04062	536 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ELK4	P28324	431 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ALDH3A2	P51648	485 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TUBA4A	P68366	448 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SH3BP2	P78314	561 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PIGF	Q07326	219 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	KCNAB2	Q13303	367 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	IL18R1	Q13478	541 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	RANBP10	Q6VN20	620 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZVU0	165 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	KRT74	Q7RTS7	529 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SYVN1	Q86TM6	617 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FAM124A	Q86V42	546 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TMEM199	Q8N511	208 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	SLC9A6	Q92581	669 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	KCNJ9	Q92806	393 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	VMP1	Q96GC9	406 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	COQ7	Q99807	217 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	DUX4	Q9UBX2	424 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	FZD4	Q9ULV1	537 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CACNA1S	Q13698	1873 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CAPN14	A8MX76	684 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	MANBA	O00462	879 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	AXIN1	O15169	862 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR1F1	O43749	312 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR10H2	O60403	315 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CCNB2	O95067	398 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TFPT	P0C1Z6	253 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CES5A	Q6NT32	575 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR2AP1	Q8NGE2	309 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PSKH2	Q96QS6	385 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	KCNS3	Q9BQ31	491 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	CNPPD1	Q9BV87	410 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR2AG1	Q9H205	316 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	GSAP	A4D1B5	854 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	STX16	O14662	325 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ZW10	O43264	779 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	XPNPEP2	O43895	674 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	IFNA16	P05015	189 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	EPHX1	P07099	455 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	RGS8	P57771	180 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	OR4D2	P58180	307 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TIGD6	Q17RP2	521 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	RFTN2	Q52LD8	501 aa	Predicted RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	COLEC12	Q5KU26	742 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	ISCA2	Q86U28	154 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		7.87	□□□□□ -1.15
NEK1-208	ENST00000512193	PARG	Q86W56	976 aa		7.87	□□□□□ -1.15

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