RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC5A12Q1EHB4 618 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM164Q5U3C3 297 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 RAPH1Q70E73 1250 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC41A2Q96JW4 573 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 MAP3K3Q99759 626 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CAB39LQ9H9S4 337 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC189A1A4V9 331 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ISM1B1AKI9 464 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 KRT37O76014 449 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 SYF2O95926 243 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 MPOP05164 745 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 NELFEP18615 380 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINB8P50452 374 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ERVPABLB-1P60509 514 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 HSD11B2P80365 405 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC29A2Q14542 456 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TMTC4Q5T4D3 741 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 MROH9Q5TGP6 573 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM207Q6UWW9 146 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ATL1Q8WXF7 558 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 SMPDL3AQ92484 453 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PKP4Q99569 1192 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 THSD1Q9NS62 852 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TLK1Q9UKI8 766 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CEP295Q9C0D2 2601 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A087X1B8 175 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 UGT2B7P16662 529 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PNLIPRP1P54315 467 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP1CAP62136 330 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM129CQ86XR2 697 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 LINC01555Q8NAE3 123 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 MTBPQ96DY7 904 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC46A1Q96NT5 459 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2A14Q96R47 310 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ZPBPQ9BS86 351 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXO8Q9NRD0 319 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PDE10AQ9Y233 779 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 BTRCQ9Y297 605 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 A0A0J9YY10 115 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 EFCAB7A8K855 629 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC16A8O95907 504 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 OAS2P29728 719 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 MC2RQ01718 297 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ACY1Q03154 408 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF460Q14592 562 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CCSMST1Q4G0I0 132 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXR1Q6PIV2 292 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 DENND1AQ8TEH3 1009 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 UBXN10Q96LJ8 280 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 IL17FQ96PD4 163 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TAAR9Q96RI9 348 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 DDA1Q9BW61 102 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PISDQ9UG56 409 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB21Q9UL25 225 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 ACOT9Q9Y305 439 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TNFSF15O95150 251 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC166P0CW27 439 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CCND1P24385 295 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TYK2P29597 1187 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 SEPHS1P49903 392 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CDKL1Q00532 357 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 IL11RAQ14626 422 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 SYTL1Q8IYJ3 562 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 DCAKDQ8WVC6 231 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 CAVIN3Q969G5 261 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 DHRS4Q9BTZ2 278 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PCBD2Q9H0N5 130 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 NMRAL1Q9HBL8 299 aa25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-212ENST00000508338 PDE7BQ9NP56 450 aa25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms