RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495100.1

GPC1-209, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GPC1, Length 3,525 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-209ENST00000495100 CFAP99D6REC4 459 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 BCKDKO14874 412 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 SYN3O14994 580 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ATP6V1G1O75348 118 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 GPIP06744 558 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 NNMTP40261 264 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 KIR3DL1P43629 444 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 SPDYE7PQ495Y7 208 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 GAB3Q8WWW8 586 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 RAD21L1Q9H4I0 556 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 MARCH5Q9NX47 278 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ARID1AO14497 2285 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 MYO1DO94832 1006 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 EPHA2P29317 976 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 TLE2Q04725 743 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 NPAS4Q8IUM7 802 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 TMEM39AQ9NV64 488 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 WNT6Q9Y6F9 365 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 H3BMQ9 156 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 K7EPI3 171 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 NME6O75414 186 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 TRBC1P01850 177 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ENGP17813 658 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 RCAN2Q14206 197 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 TXNDC11Q6PKC3 985 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CARM1Q86X55 608 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CFAP206Q8IYR0 622 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 COG8Q96MW5 612 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 NRTNQ99748 197 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 OR51B5Q9H339 312 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ZNF385DQ9H6B1 395 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 C1orf109Q9NX04 203 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ERVK-18Q9QC07 812 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa13.13□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 BRWD1Q9NSI6 2320 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ILVBLA1L0T0 632 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 LATO43561 262 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CREG1O75629 220 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 EPN2O95208 641 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 PGLSO95336 258 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 OR56A5P0C7T3 313 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 RAP2AP10114 183 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CDK9P50750 372 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 MGAT3Q09327 533 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 LMAN2Q12907 356 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 GRM2Q14416 872 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ADRM1Q16186 407 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ADHFE1Q8IWW8 467 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 C10orf111Q8N326 155 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 MINDY1Q8N5J2 469 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 NODALQ96S42 347 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 MGME1Q9BQP7 344 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 SGK2Q9HBY8 427 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 IL17CQ9P0M4 197 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 B4GALT6Q9UBX8 382 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CKAP5Q14008 2032 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 SPTBP11277 2137 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 OR7A17O14581 309 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 VPS4BO75351 444 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 SPAM1P38567 509 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CD47Q08722 323 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ZBED5Q49AG3 693 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CCSMST1Q4G0I0 132 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CYBRD1Q53TN4 286 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 TMEM25Q86YD3 366 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 NLGN4XQ8N0W4 816 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 IL17FQ96PD4 163 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 KRT84Q9NSB2 600 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 SCN3BQ9NY72 215 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 BLOC1S6Q9UL45 172 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 CCL26Q9Y258 94 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 NCS1P62166 190 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 RAPSNQ13702 412 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 KRT33BQ14525 404 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 DSC3Q14574 896 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 RD3Q7Z3Z2 195 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 FAM217AQ8IXS0 508 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 SLC15A4Q8N697 577 aa13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
GPC1-209ENST00000495100 KCNJ9Q92806 393 aa13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms