RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492283.1

RBMS1-215, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 5

Gene RBMS1, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-215	ENST00000492283	CTBP1	Q13363	440 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	TUBB3	Q13509	450 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	MORF4L2	Q15014	288 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	TMEM135	Q86UB9	458 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CARF	Q8N187	725 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	BBOF1	Q8ND07	529 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	NKD1	Q969G9	470 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	PMEPA1	Q969W9	287 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SNF8	Q96H20	258 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	P2RY12	Q9H244	342 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	FANCE	Q9HB96	536 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	APMAP	Q9HDC9	416 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	C1GALT1	Q9NS00	363 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	INTS10	Q9NVR2	710 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	IL1RAPL1	Q9NZN1	696 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	BTN3A1	O00481	513 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	VPS4B	O75351	444 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	GPC4	O75487	556 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SLCO2B1	O94956	709 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	GNLY	P22749	145 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ITGA8	P53708	1063 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ARL4C	P56559	192 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CALCOCO2	Q13137	446 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	HP1BP3	Q5SSJ5	553 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	KCNMB4	Q86W47	210 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ZBTB2	Q8N680	514 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ESX1	Q8N693	406 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	LPGAT1	Q92604	370 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM136A	Q96C01	138 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CFAP36	Q96G28	342 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CATSPER2	Q96P56	530 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SLC7A5P2	Q9GIP4	190 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	FGF21	Q9NSA1	209 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ACTR10	Q9NZ32	417 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	POMT2	Q9UKY4	750 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	VPS4A	Q9UN37	437 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SNX24	Q9Y343	169 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	APC	P25054	2843 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SDK2	Q58EX2	2172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	NIPSNAP2	O75323	286 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	SPAG6	O75602	509 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	KIAA0754	O94854	1291 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	S1PR4	O95977	384 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	MT-ND3	P03897	115 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	EBLN1	P0CF75	366 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	LIF	P15018	202 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	FOLR1	P15328	257 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	MAGEA3	P43357	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	TUBB4B	P68371	445 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	TUBB2A	Q13885	445 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	HIF1A	Q16665	826 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBMS1-215	ENST00000492283	CENPU	Q71F23	418 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms