RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475912.1

PRKD3-208, Transcript of protein kinase D3, human

TSL 3

Gene PRKD3, Length 760 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKD3-208	ENST00000475912	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TTC14	Q96N46	770 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	PCYT2	Q99447	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ERAP1	Q9NZ08	941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TMEM202	A6NGA9	273 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CRYAA	P02489	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TF	P02787	698 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CAPN3	P20807	821 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ABCD3	P28288	659 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	HOXC13	P31276	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	MAGEA9	P43362	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CLCN3	P51790	818 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CASP6	P55212	293 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	UFM1	P61960	85 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	GIT2	Q14161	759 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	GPR68	Q15743	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	BAK1	Q16611	211 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CTF1	Q16619	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	HYI	Q5T013	277 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TXNDC8	Q6A555	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	RRM2B	Q7LG56	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	FUZ	Q9BT04	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	MMP28	Q9H239	520 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF711	Q9Y462	761 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	POLR2M	P0CAP2	368 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	HLA-DOB	P13765	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	MCM3	P25205	808 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC11A1	P49279	550 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	NME8	Q8N427	588 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	IL17RC	Q8NAC3	791 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	KLHL15	Q96M94	604 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	UHRF2	Q96PU4	802 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	SMARCAD1	Q9H4L7	1026 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	NEDD4	P46934	1319 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ZBTB5	O15062	677 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	LDLRAD4	O15165	306 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	TEX28	O15482	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	STAM2	O75886	525 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	F9	P00740	461 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	VTN	P04004	478 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	PRB1	P04280	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	IRF1	P10914	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CDH1	P12830	882 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	COX7A2	P14406	83 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	MAOA	P21397	527 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	CASP2	P42575	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	HAND2	P61296	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	NTHL1	P78549	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	SYT16	Q17RD7	645 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKD3-208	ENST00000475912	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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