RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470197.5

GCFC2-205, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 1 (best)

Gene GCFC2, Length 3,648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	CAMK1G	Q96NX5	476 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	POLDIP3	Q9BY77	421 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF536	O15090	1300 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	HIST1H2AB	P04908	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	HIST1H2AD	P20671	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	FOLR3	P41439	243 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	HTR6	P50406	440 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	CCT8	P50990	548 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	SIRPA	P78324	504 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PRKCE	Q02156	737 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	EGR4	Q05215	589 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	VGLL4	Q14135	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	UROC1	Q96N76	676 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ADO	Q96SZ5	270 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	SLA2	Q9H6Q3	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	FAM153A	Q9UHL3	310 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	CACNA1S	Q13698	1873 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	MAST3	O60307	1309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	MEIS2	O14770	477 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ACTN1	P12814	892 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PRCP	P42785	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	MAGEA4	P43358	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	GALK2	Q01415	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	GUCY1B3	Q02153	619 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	HHEX	Q03014	270 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	LINGO2	Q7L985	606 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	SERGEF	Q9UGK8	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ERVK-11	Q9UQG0	969 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197		A6NNC1	897 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	IL4R	P24394	825 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	FOXI1	Q12951	378 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PDE7A	Q13946	482 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	KCNA10	Q16322	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	CERS5	Q8N5B7	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	RNF183	Q96D59	192 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	BICD1	Q96G01	975 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	GPR132	Q9UNW8	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	SNED1	Q8TER0	1413 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197		A0A1W2PPQ1	181 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PEX1	O43933	1283 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	GLCE	O94923	617 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PLG	P00747	810 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PLAU	P00749	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	BEX3	Q00994	111 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	TRIM29	Q14134	588 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	MELK	Q14680	651 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	BICD2	Q8TD16	824 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	APBB2	Q92870	758 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PKP2	Q99959	881 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	TIMM23	O14925	209 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	MT-ATP6	P00846	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	MYF6	P23409	242 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	TNFSF8	P32971	234 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	PRMT2	P55345	433 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	TFAP4	Q01664	338 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GCFC2-205	ENST00000470197	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67

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