RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa8.56□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RNF112Q9ULX5 631 aa8.56□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PIPSLA2A3N6 862 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 FAM221BA6H8Z2 402 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 A8MU76 341 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 C2orf74A8MZ97 194 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ISM1B1AKI9 464 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CSO75390 466 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RASSF9O75901 435 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KLHL2O95198 593 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 UQCRHP07919 91 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PYGBP11216 843 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 JUPP14923 745 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TFEBP19484 476 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 IMPA1P29218 277 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KCNC1P48547 511 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PDX1P52945 283 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PNLIPRP1P54315 467 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 INHBCP55103 352 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 FOXC1Q12948 553 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SQSTM1Q13501 440 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RASA2Q15283 850 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CYP2A13Q16696 494 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PPP1R3AQ16821 1122 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CEP85LQ5SZL2 805 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ANKS6Q68DC2 871 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KLC3Q6P597 504 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SUSD1Q6UWL2 747 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ISCA2Q86U28 154 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM73Q86UV7 250 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 GPSM1Q86YR5 675 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SYTL1Q8IYJ3 562 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RCBTB1Q8NDN9 531 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 OR4D9Q8NGE8 314 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 OR2L8Q8NGY9 312 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF480Q8WV37 535 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ANKRD7Q92527 254 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KIAA1191Q96A73 305 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 MED8Q96G25 268 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ZDHHC12Q96GR4 267 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CABS1Q96KC9 395 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SCYL1Q96KG9 808 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC74BQ96LY2 380 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PPM1MQ96MI6 270 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 DEPDC7Q96QD5 511 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 EGFL8Q99944 293 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TMEM109Q9BVC6 243 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CENPHQ9H3R5 247 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ACTR10Q9NZ32 417 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SPATA7Q9P0W8 599 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 LGALS13Q9UHV8 139 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CLCA2Q9UQC9 943 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 OARD1Q9Y530 152 aa8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RP1P56715 2156 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF839A8K0R7 811 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SUPT3HO75486 399 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 S100BP04271 92 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ANXA5P08758 320 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 THRAP10827 490 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ERGP11308 486 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 COL6A2P12110 1019 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 UGT2B7P16662 529 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KRT4P19013 534 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PSMB5P28074 263 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 HSD17B2P37059 387 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SEPHS1P49903 392 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 AP1S2P56377 157 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CASP8Q14790 479 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ARHGAP19Q14CB8 494 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 ACAP2Q15057 778 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 TGFBIQ15582 683 aa8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CASQ1-202ENST00000467691 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms