RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LONRF1Q17RB8 773 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCSMST1Q4G0I0 132 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LCN10Q6JVE6 187 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTC23LQ6PF05 361 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF605Q86T29 641 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLHL7Q8IXQ5 586 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DSELQ8IZU8 1212 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2L8Q8NGY9 312 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOPNLQ96NB1 174 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR87Q9BY21 358 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CHST8Q9H2A9 424 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCMTD2Q9NV79 361 aa15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BSNQ9UPA5 3926 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDC14CA4D256 554 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 B8ZZF3 427 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 H3BMH7 237 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MEN1O00255 615 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FANCGO15287 622 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF749O43361 778 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BANF1O75531 89 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPTBP11277 2137 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PGAM1P18669 254 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGP20916 626 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IVDP26440 423 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTPN4P29074 926 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCNFP41002 786 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MPP1Q00013 466 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNAB2Q13303 367 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACSBG2Q5FVE4 666 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PCGF5Q86SE9 256 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR135Q8IZ08 494 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC22A18Q96BI1 424 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADNPQ9H2P0 1102 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STARD5Q9NSY2 213 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLHL20Q9Y2M5 609 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRFAP1Q9Y605 127 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM169AQ9Y6X4 670 aa15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2B3O76000 313 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MATN4O95460 622 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CTSBP07858 339 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PLA2G2AP14555 144 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLCN7P51798 805 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DR1Q01658 176 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRYMQ14894 314 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLHL38Q2WGJ6 581 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PTCHD3Q3KNS1 767 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MSS51Q4VC12 460 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNMB4Q86W47 210 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAJC22Q8N4W6 341 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GIMAP7Q8NHV1 300 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CALML6Q8TD86 181 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DENND1AQ8TEH3 1009 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC30A3Q99726 388 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM167BQ9BTA0 163 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC25A18Q9H1K4 315 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC68Q9H2F9 335 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXO5Q9UKT4 447 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POLHQ9Y253 713 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MED16Q9Y2X0 877 aa14.99□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ARHGEF33A8MVX0 844 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RECKO95980 971 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HBQ1P09105 142 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TTLL9Q3SXZ7 439 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BBS9Q3SYG4 887 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM198BQ6UWH4 519 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYVN1Q86TM6 617 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB42Q8N4Z0 105 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGEC3Q8TD91 643 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNJ9Q92806 393 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RUNDC3BQ96NL0 473 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIM51Q9BSJ1 452 aa14.98□□□□□ -0.01
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms