RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444685.1

CBX1-204, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CBX1, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-204ENST00000444685 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 FBXL4Q9UKA2 621 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 E2F3O00716 465 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MATN3O15232 486 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 OIP5O43482 229 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 SUSD5O60279 629 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MTX2O75431 263 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 RASAL1O95294 804 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 PEX11BO96011 259 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 SLC4A1P02730 911 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MSH3P20585 1137 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MMP11P24347 488 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CCNCP24863 283 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 DCDC1P59894 354 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 DSC2Q02487 901 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 ID3Q02535 119 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 PTP4A2Q12974 167 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 ABRQ12979 859 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MFAP5Q13361 173 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MAMLD1Q13495 774 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 DPYSQ14117 519 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 KRT81Q14533 505 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 INAQ16352 499 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 LONRF2Q1L5Z9 754 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 TUBB8Q3ZCM7 444 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 KRTCAP3Q53RY4 240 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CES4AQ5XG92 561 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 METRNLQ641Q3 311 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 ACAD10Q6JQN1 1059 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 RHBDD2Q6NTF9 364 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 IGFL2Q6UWQ7 119 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 ZNF547Q8IVP9 402 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MCOLN2Q8IZK6 566 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 TEX26Q8N6G2 289 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CCNYQ8ND76 341 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 GPR26Q8NDV2 337 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 FAM13CQ8NE31 585 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CATSPER1Q8NEC5 780 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 UBASH3BQ8TF42 649 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 HSPH1Q92598 858 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 DLG3Q92796 817 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MAGED4Q96JG8 741 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 C12orf66Q96MD2 445 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 VPS35Q96QK1 796 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 WDR24Q96S15 920 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 PCDHB18PQ96TA0 734 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 AGPAT1Q99943 283 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 COQ3Q9NZJ6 369 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 SLC24A2Q9UI40 661 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 ADAM30Q9UKF2 790 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 SHOC2Q9UQ13 582 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CCDC88CQ9P219 2028 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 ABCA4P78363 2273 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 ANKRD12Q6UB98 2062 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CCDC78A2IDD5 438 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 MGAT4DA6NG13 374 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 OR2AG2A6NM03 316 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 C2orf74A8MZ97 194 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 KDM1AO60341 852 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 SLC19A2O60779 497 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 USP1O94782 785 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 PRLP01236 227 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 POLBP06746 335 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CBSLP0DN79 551 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 RALBP11234 206 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 NID1P14543 1247 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 FOSL1P15407 271 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 KLK2P20151 261 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CXCR2P25025 360 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 AKT1P31749 480 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CBSP35520 551 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 CD86P42081 329 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 SSR1P43307 286 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 LMAN1P49257 510 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 ARSFP54793 590 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 KRTAP10-9P60411 292 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 AP2B1P63010 937 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 DMPKQ09013 629 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-204ENST00000444685 Q0VFX4 171 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms