RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393537.4

ANKRD39-201, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD39, Length 976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-201ENST00000393537 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ACSBG2Q5FVE4 666 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 LMNTD2Q8IXW0 634 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CALML6Q8TD86 181 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR87Q9BY21 358 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CHST8Q9H2A9 424 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC68Q9H2F9 335 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ACTL8Q9H568 366 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 FBXO5Q9UKT4 447 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHL20Q9Y2M5 609 aa19.51■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CDC14CA4D256 554 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 FANCGO15287 622 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF749O43361 778 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 OR2B3O76000 313 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SFTPCP11686 197 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGP20916 626 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 RORAP35398 523 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CCNFP41002 786 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 PAFAH1B1P43034 410 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 GABRA4P48169 554 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CLCN7P51798 805 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS15P62841 145 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 MPP1Q00013 466 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 NFATC3Q12968 1075 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 MSS51Q4VC12 460 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF549Q6P9A3 640 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNMB4Q86W47 210 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 GPR135Q8IZ08 494 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 DSELQ8IZU8 1212 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 RAB42Q8N4Z0 105 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC22A18Q96BI1 424 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 RUNDC3BQ96NL0 473 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 TRIM51Q9BSJ1 452 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 FAM167BQ9BTA0 163 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ADNPQ9H2P0 1102 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 PCMTD2Q9NV79 361 aa19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CCDC188H7C350 402 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 MATN4O95460 622 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 FURINP09958 794 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 PTPN4P29074 926 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 RPS18P62269 152 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CRYMQ14894 314 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SF1Q15637 639 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 KLHL38Q2WGJ6 581 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 BBS9Q3SYG4 887 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 LCN10Q6JVE6 187 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ZNF605Q86T29 641 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SYTL1Q8IYJ3 562 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 DNAJC22Q8N4W6 341 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 MAGEC3Q8TD91 643 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SLC30A3Q99726 388 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 MED16Q9Y2X0 877 aa19.49■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 B8ZZF3 427 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 TTI1O43156 1089 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CTSBP07858 339 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 HBQ1P09105 142 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ERVK-10P10266 1014 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 KCNAB2Q13303 367 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 CUL1Q13616 776 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 MORF4L2Q15014 288 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 PTCHD3Q3KNS1 767 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 TTLL9Q3SXZ7 439 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SPNS2Q8IVW8 549 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 GIMAP7Q8NHV1 300 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 DENND1AQ8TEH3 1009 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 NAT9Q9BTE0 207 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 STARD5Q9NSY2 213 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 IRAK4Q9NWZ3 460 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 PLCL2Q9UPR0 1127 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 POLHQ9Y253 713 aa19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 FASNP49327 2511 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SEC16AO15027 2179 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 FER1L5A0AVI2 2057 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 ARHGEF33A8MVX0 844 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 H3BMH7 237 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 HAUS5O94927 633 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 TTC4O95801 387 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 RECKO95980 971 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SPANXN3Q5MJ09 141 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 SYVN1Q86TM6 617 aa19.47■□□□□ 0.71
ANKRD39-201ENST00000393537 IGDCC3Q8IVU1 814 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms