RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384508.1

RNU6-110P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 110, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-110P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-110P-201ENST00000384508 PTGFRP43088 359 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SLC6A12P48065 614 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SLC1A6P48664 564 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 LHX1P48742 406 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PEX5P50542 639 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CCT8P50990 548 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 AIF1P55008 147 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MFAP3P55082 362 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 GP2P55259 537 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TPTEP56180 551 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 P2RX3P56373 397 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HUNKP57058 714 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ISL1P61371 349 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 BTG1P62324 171 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PPIAP62937 165 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HERV-K104P63124 156 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SIRPAP78324 504 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 COG7P83436 770 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ARF5P84085 180 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CDK3Q00526 305 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ACY1Q03154 408 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TFF2Q03403 129 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ITIH3Q06033 890 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ENPEPQ07075 957 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 DMTNQ08495 405 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 FAM27E3Q08E93 113 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TMEM62Q0P6H9 643 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 BST1Q10588 318 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PMPCAQ10713 525 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CETN1Q12798 172 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 KIF5AQ12840 1032 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 COX10Q12887 443 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ABRQ12979 859 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HSPB3Q12988 150 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CDH18Q13634 790 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 KRT33BQ14525 404 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HNF4GQ14541 408 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PTPRRQ15256 657 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PTPAQ15257 358 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TPSAB1Q15661 275 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CAMK4Q16566 473 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PTGISQ16647 500 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CA9Q16790 459 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MEP1AQ16819 746 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF284Q2VY69 593 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ANKRD55Q3KP44 614 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TBC1D25Q3MII6 688 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF528Q3MIS6 628 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CCDC40Q4G0X9 1142 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 BCL7AQ4VC05 210 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MIDNQ504T8 468 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SYT14P1Q58G82 188 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 CMPK2Q5EBM0 449 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 EPHA10Q5JZY3 1008 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 RABGAP1LQ5R372 815 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 C9orf50Q5SZB4 431 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 C6orf141Q5SZD1 244 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PDSS1Q5T2R2 415 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ZNF618Q5T7W0 954 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TSTD2Q5T7W7 516 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 GRTP1Q5TC63 336 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PRAMEF20Q5VT98 475 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 FNDC7Q5VTL7 733 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TAF3Q5VWG9 929 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 FAM46CQ5VWP2 391 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 LIPKQ5VXJ0 399 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 C18orf63Q68DL7 685 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 SIGIRRQ6IA17 410 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ASPHD2Q6ICH7 369 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 OR4C11Q6IEV9 310 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 ETFRF1Q6IPR1 90 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PYHIN1Q6K0P9 492 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MFSD12Q6NUT3 480 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 RGMBQ6NW40 437 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 AAGABQ6PD74 315 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 TMEM65Q6PI78 240 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 MPZL3Q6UWV2 235 aa0.69□□□□□ -2.3
RNU6-110P-201ENST00000384508 DLEU7Q6UYE1 221 aa0.69□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms