RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 POLE4Q9NR33 117 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 GPRC5BQ9NZH0 403 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 LHX3Q9UBR4 397 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 PPT2Q9UMR5 302 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 M0QX08 132 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 SLC28A1O00337 649 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 AQP9O43315 295 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 PRAMEF1O95521 474 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 FADS2O95864 444 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 TGM1P22735 817 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 MBTPS1Q14703 1052 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ACOX1Q15067 660 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 INAQ16352 499 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 INAVAQ3KP66 663 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 LRRC8DQ7L1W4 858 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 STK40Q8N2I9 435 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 UBE2FQ969M7 185 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 SLC35B4Q969S0 331 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 GPR63Q9BZJ6 419 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 CLPBQ9H078 707 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 DUSP21Q9H596 190 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.35■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ILVBLA1L0T0 632 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 SLC38A8A6NNN8 435 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 PER2O15055 1255 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 DNAJB5O75953 348 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 EPORP19235 508 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 MAGEA2P43356 314 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 GTF2H3Q13889 308 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 PGS1Q32NB8 556 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 CATSPEREQ5SY80 951 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 LRIF1Q5T3J3 769 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 FKBP9P1Q75LS8 142 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 OR6K2Q8NGY2 324 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 USP7Q93009 1102 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 SH3GL1Q99961 368 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 HEPHQ9BQS7 1158 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ABCG8Q9H221 673 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 DNMT3LQ9UJW3 386 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 M0R3G1 203 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 SYN3O14994 580 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 SLC22A1O15245 554 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 CLDN11O75508 207 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ZNF682O95780 498 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 PSMB9P28065 219 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 IL18R1Q13478 541 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 KCNA10Q16322 511 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 CARNMT1Q8N4J0 409 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ITPKCQ96DU7 683 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 SPATA17Q96L03 361 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 TSSK3Q96PN8 268 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ORC6Q9Y5N6 252 aa18.34■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 hCG_2039718K7EN88 272 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 FZD6O60353 706 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ADAMTS4O75173 837 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 LRATO95237 230 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 SLC11A2P49281 568 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 GATMP50440 423 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 FKBP1BP68106 108 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 CLCA4Q14CN2 919 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 RTP2Q5QGT7 225 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 C17orf99Q6UX52 265 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 P2RY8Q86VZ1 359 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 TRIB2Q92519 343 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 PYCR2Q96C36 320 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 NACA2Q9H009 215 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ATAD3AQ9NVI7 634 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 ASIC5Q9NY37 505 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 WDR37Q9Y2I8 494 aa18.33■□□□□ 0.53
CITED2-201ENST00000367651 A0A096LPI6 279 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 PDYNP01213 254 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 IRF1P10914 325 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 JUNDP17535 347 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 HOXA9P31269 272 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 HMGCLP35914 325 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 NEK2P51955 445 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 RPS14P62263 151 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 MAPK11Q15759 364 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 CST9Q5W186 159 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 EGLN2Q96KS0 407 aa18.33■□□□□ 0.52
CITED2-201ENST00000367651 KCNH6Q9H252 994 aa18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.4 ms