RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GMEB2Q9UKD1 530 aa26.62■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR56A3Q8NH54 315 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 TRPC4APQ8TEL6 797 aa26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SH3KBP1Q96B97 665 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 C7orf26Q96N11 449 aa26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC40A1Q9NP59 571 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 STK38LQ9Y2H1 464 aa26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 KNL1Q8NG31 2342 aa26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LCP2Q13094 533 aa26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP2A13Q16696 494 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EPN3Q9H201 632 aa26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A14Q9Y267 594 aa26.6■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 E7ENX8 843 aa26.59■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ALPPL2P10696 532 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCR10P46092 362 aa26.59■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PRKAA1Q13131 559 aa26.59■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC25A45Q8N413 288 aa26.59■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMPDL3AQ92484 453 aa26.59■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 XKR8Q9H6D3 395 aa26.59■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2L8Q8NGY9 312 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM107BQ9H098 131 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 SRMSQ9H3Y6 488 aa26.58■■□□□ 1.85
CTDNEP1-201ENST00000318988 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ICKQ9UPZ9 632 aa26.58■■□□□ 1.85
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