RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 CTPS2Q9NRF8 586 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 UCKL1Q9NWZ5 548 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A1W2PRB8 838 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIA1P42261 906 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2G16P53816 162 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC18A1P54219 525 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SYT16Q17RD7 645 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 OR14C36Q8NHC7 312 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PKP2Q99959 881 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 GAL3ST1Q99999 423 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TLR4O00206 839 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 IFI30P13284 250 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC10A6Q3KNW5 377 aa23.68■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ECI2O75521 394 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.388e-6■■□□□ 13
GNPTAB-201ENST00000299314 ZSWIM3Q96MP5 696 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 DCSTAMPQ9H295 470 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 FZD4Q9ULV1 537 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 NFATC1O95644 943 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 AVPR1BP47901 424 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 AP1S2P56377 157 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 LGI4Q8N135 537 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM18Q96H35 190 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 COQ4Q9Y3A0 265 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PAQR3Q6TCH7 311 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 F7P08709 466 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SELPP16109 830 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 NRLP54845 237 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 FUT10Q6P4F1 479 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.67■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGB1P05556 798 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ECHS1P30084 290 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBA4AP68366 448 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 MARK1Q9P0L2 795 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PRH1P02810 166 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ENGP17813 658 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PRPS1L1P21108 318 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CBLBQ13191 982 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNJ11Q14654 390 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ANO7Q6IWH7 933 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 B3GALT2O43825 422 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 HLA-DQB2P05538 268 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF823P16415 610 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PTGS2P35354 604 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SPERTQ8NA61 448 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC39A3Q9BRY0 314 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 MLXQ9UH92 298 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM233B4DJY2 109 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 LINGO3P0C6S8 592 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 DSC3Q14574 896 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CRB2Q5IJ48 1285 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 OR5T3Q8NGG3 340 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PMM1Q92871 262 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 HAPLN3Q96S86 360 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CGREF1Q99674 301 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 C1orf21Q9H246 121 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF639Q9UID6 485 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 FUT4P22083 530 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 IL12BP29460 328 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 PDSS2Q86YH6 399 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SETD6Q8TBK2 473 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 METTL21AQ8WXB1 218 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 GAL3ST4Q96RP7 486 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC35A5Q9BS91 424 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC6A15Q9H2J7 730 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ZIM2Q9NZV7 527 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ERVW-1Q9UQF0 538 aa23.66■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CPN2P22792 545 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TPRG1LQ5T0D9 272 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ASB18Q6ZVZ8 466 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 OR6C70A6NIJ9 312 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 IQCHQ86VS3 1027 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 HIPK3Q9H422 1215 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 POFUT2Q9Y2G5 429 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CD2P06729 351 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 HMGCS1Q01581 520 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CRY2Q49AN0 593 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 C9IYK1 514 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 TM4SF1P30408 202 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 GJA9P57773 515 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 EPGNQ6UW88 154 aa23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms