RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262887.9

XRCC1-201, Transcript of X-ray repair cross complementing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene XRCC1, Length 2,802 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1-201ENST00000262887 MSRB3Q8IXL7 192 aa14.65□□□□□ -0.06
XRCC1-201ENST00000262887 SCAMP5Q8TAC9 235 aa14.65□□□□□ -0.06
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XRCC1-201ENST00000262887 ELMO1Q92556 727 aa14.65□□□□□ -0.06
XRCC1-201ENST00000262887 PEX13Q92968 403 aa14.65□□□□□ -0.06
XRCC1-201ENST00000262887 TRIM63Q969Q1 353 aa14.65□□□□□ -0.06
XRCC1-201ENST00000262887 PSMG2Q969U7 264 aa14.65□□□□□ -0.06
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XRCC1-201ENST00000262887 TRIM62Q9BVG3 475 aa14.65□□□□□ -0.06
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XRCC1-201ENST00000262887 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
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XRCC1-201ENST00000262887 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa14.64□□□□□ -0.07
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XRCC1-201ENST00000262887 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.64□□□□□ -0.07
XRCC1-201ENST00000262887 SEC22BO75396 215 aa14.64□□□□□ -0.07
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XRCC1-201ENST00000262887 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.64□□□□□ -0.07
XRCC1-201ENST00000262887 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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XRCC1-201ENST00000262887 ZNF682O95780 498 aa14.62□□□□□ -0.07
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XRCC1-201ENST00000262887 SMU1Q2TAY7 513 aa14.62□□□□□ -0.07
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