RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637887.1

ARID1B-231, Transcript of AT-rich interaction domain 1B, human

TSL 5

Gene ARID1B, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARID1B-231	ENST00000637887	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.52	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	SVOP	Q8N4V2	548 aa		10.52	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	GPAM	Q9HCL2	828 aa		10.52	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	TLR1	Q15399	786 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		10.51	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	POM121C	A8CG34	1229 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	GDF10	P55107	478 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	WWC1	Q8IX03	1113 aa		10.5	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	INHA	P05111	366 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	THBS1	P07996	1170 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	SKI	P12755	728 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		10.49	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	MBIP	Q9NS73	344 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		10.48	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887		A0A1B0GTH6	734 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		10.47	□□□□□ -0.73
ARID1B-231	ENST00000637887	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	ARHGEF15	O94989	841 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	MSX1	P28360	303 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	RUBCNL	Q9H714	662 aa		10.46	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	IGF1R	P08069	1367 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	EML3	Q32P44	896 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	PLA2G4A	P47712	749 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	SMTN	P53814	917 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	NCOA4	Q13772	614 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	NOD1	Q9Y239	953 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L5	A8MUK1	530 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	MX2	P20592	715 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	GSK3A	P49840	483 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	GTF2I	P78347	998 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	PGBD3	Q8N328	593 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	USP3	Q9Y6I4	520 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	KCNMA1	Q12791	1236 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		10.41	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	PSME1	Q06323	249 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	ACD	Q96AP0	544 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	AIDA	Q96BJ3	306 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.4	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
ARID1B-231	ENST00000637887		A6NJY4	79 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	10.39	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		10.39	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	MTFR1	Q15390	333 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	EFHC2	Q5JST6	749 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		10.38	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	CDK2AP1	O14519	115 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	ATP4A	P20648	1035 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	ZNF358	Q9NW07	568 aa		10.37	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L3	A6NCW0	530 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L4	A6NCW7	530 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	BCR	P11274	1271 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	CABP1	Q9NZU7	370 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	PHF24	Q9UPV7	400 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		10.36	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	RASSF7	Q02833	373 aa		10.35	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	BACH1	O14867	736 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	BNIP3L	O60238	219 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	IRS1	P35568	1242 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		10.34	□□□□□ -0.75
ARID1B-231	ENST00000637887	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	ATP9B	O43861	1147 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	NDFIP2	Q9NV92	336 aa		10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	10.33	□□□□□ -0.76
ARID1B-231	ENST00000637887	GDF11	O95390	407 aa		10.32	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms