RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 POLKQ9UBT6 870 aa37.83■■■■□ 3.65
CAPNS1-217ENST00000629983 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP37.81■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC3LQ5T215 181 aa37.8■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 BCS1LQ9Y276 419 aa37.79■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF3CO14782 793 aa37.78■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 PXDNLA1KZ92 1463 aa37.77■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 NLGN1Q8N2Q7 840 aa37.76■■■■□ 3.64
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A0G2JLW4 131 aa37.74■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 KDRP35968 1356 aa37.74■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 TGFB2P61812 414 aa37.74■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP37.73■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC87Q9NVE4 849 aa37.72■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa37.71■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVV-2B6SEH9 535 aa37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 RFC4P35249 363 aa37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC4A9Q96Q91 983 aa37.7■■■■□ 3.63
CAPNS1-217ENST00000629983 ADRA2BP18089 450 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP3Q9Y6F1 533 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf71Q711Q0 1435 aa37.69■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF5Q96JK2 942 aa37.68■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 FCHSD2O94868 740 aa37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 DPEP1P16444 411 aa37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CABP4P57796 275 aa37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa37.66■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa37.65■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 GYS1P13807 737 aa37.65■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS6KA4O75676 772 aa37.64■■■■□ 3.62
CAPNS1-217ENST00000629983 APLP1P51693 650 aa37.63■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 TOMM70O94826 608 aa37.6■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 AMOTQ4VCS5 1084 aa37.59■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf141Q5JVX7 400 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 NMRK2Q9NPI5 230 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF13BQ9NQT8 1826 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa37.58■■■■□ 3.61
CAPNS1-217ENST00000629983 C4AP0C0L4 1744 aa37.57■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 MTHFSP49914 203 aa37.57■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.54■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf131Q5VYM1 1079 aa37.54■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 CRKLP46109 303 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF831Q5JPB2 1677 aa37.53■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 PIM2Q9P1W9 311 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa37.52■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 AEBP1Q8IUX7 1158 aa37.51■■■■□ 3.6
CAPNS1-217ENST00000629983 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-217ENST00000629983 PANK3Q9H999 370 aa37.5■■■■□ 3.59
CAPNS1-217ENST00000629983 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa37.49■■■■□ 3.59
CAPNS1-217ENST00000629983 FKBP8Q14318 412 aa37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-217ENST00000629983 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNA3P22001 575 aa37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-217ENST00000629983 MORC1Q86VD1 984 aa37.47■■■■□ 3.59
CAPNS1-217ENST00000629983 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP37.46■■■■□ 3.59
CAPNS1-217ENST00000629983 DDR1Q08345 913 aa37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-217ENST00000629983 SULT6B1Q6IMI4 303 aa37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF181Q9P0P0 153 aa37.44■■■■□ 3.58
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP37.43■■■■□ 3.58
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNA5P30532 468 aa37.41■■■■□ 3.58
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa37.41■■■■□ 3.58
CAPNS1-217ENST00000629983 KDM2BQ8NHM5 1336 aa37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP37.4■■■■□ 3.58
CAPNS1-217ENST00000629983 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.58
CAPNS1-217ENST00000629983 ZPR1O75312 459 aa37.38■■■■□ 3.57
CAPNS1-217ENST00000629983 KCPQ6ZWJ8 1503 aa37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-217ENST00000629983 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
CAPNS1-217ENST00000629983 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-217ENST00000629983 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-217ENST00000629983 USPL1Q5W0Q7 1092 aa37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC10Q8IXB1 793 aa37.35■■■■□ 3.57
CAPNS1-217ENST00000629983 HTRA3P83110 453 aa37.34■■■■□ 3.57
CAPNS1-217ENST00000629983 FSTL1Q12841 308 aa37.32■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 PCGF6Q9BYE7 350 aa37.32■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 RRAGCQ9HB90 399 aa37.32■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 TJP1Q07157 1748 aa37.32■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa37.31■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP4Q5JQC9 854 aa37.31■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 TM4SF1P30408 202 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 IL13P35225 146 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC52A2Q9HAB3 445 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 KNSTRNQ9Y448 316 aa37.3■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 KLRG1Q96E93 195 aa37.27■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR90Q96KV7 1748 aa37.27■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 RASSF7Q02833 373 aa37.26■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 CLSPNQ9HAW4 1339 aa37.26■■■■□ 3.56
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC39A6Q13433 755 aa37.25■■■■□ 3.55
CAPNS1-217ENST00000629983 LGR6Q9HBX8 967 aa37.25■■■■□ 3.55
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