RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623253.4_PAR_Y

CD99-211, Transcript of CD99 molecule (Xg blood group), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD99, Length 573 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.3■■□□□ 1.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ANKRD26Q9UPS8 1709 aa22.3■■□□□ 1.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.29■■□□□ 1.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ADCY9O60503 1353 aa22.27■■□□□ 1.16
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PCGF6Q9BYE7 350 aa22.26■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ERVV-2B6SEH9 535 aa22.25■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DCAF5Q96JK2 942 aa22.25■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CABP4P57796 275 aa22.24■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.24■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC4A9Q96Q91 983 aa22.24■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PANK3Q9H999 370 aa22.24■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y A0A0G2JLW4 131 aa22.22■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RFC4P35249 363 aa22.22■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BCS1LQ9Y276 419 aa22.22■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KDRP35968 1356 aa22.22■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HSPA6P17066 643 aa22.21■■□□□ 1.15
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MTHFSP49914 203 aa22.2■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TGFB2P61812 414 aa22.2■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AMOTQ4VCS5 1084 aa22.2■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RPS6KA4O75676 772 aa22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ADRA2BP18089 450 aa22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCDC87Q9NVE4 849 aa22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PARP3Q9Y6F1 533 aa22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PXDNLA1KZ92 1463 aa22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.18■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C1orf141Q5JVX7 400 aa22.18■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MORC1Q86VD1 984 aa22.18■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.18■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y GYS1P13807 737 aa22.17■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DPEP1P16444 411 aa22.17■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CEP350Q5VT06 3117 aa22.16■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.16■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KIF3CO14782 793 aa22.16■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.16■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FCHSD2O94868 740 aa22.15■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IFFO2Q5TF58 517 aa22.15■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.15■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C10orf71Q711Q0 1435 aa22.14■■□□□ 1.14
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C4AP0C0L4 1744 aa22.11■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.11■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KNSTRNQ9Y448 316 aa22.1■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.1■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.09■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y FKBP8Q14318 412 aa22.09■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y PIM2Q9P1W9 311 aa22.08■■□□□ 1.13
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TOMM70O94826 608 aa22.07■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KCNA3P22001 575 aa22.07■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y IL13P35225 146 aa22.07■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NMRK2Q9NPI5 230 aa22.07■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.06■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DDR1Q08345 913 aa22.05■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y APLP1P51693 650 aa22.04■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AKAP4Q5JQC9 854 aa22.04■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.04■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y ZPR1O75312 459 aa22.03■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CHRNA5P30532 468 aa22.03■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y LGR6Q9HBX8 967 aa22.03■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.02■■□□□ 1.12
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y HMOX1P09601 288 aa22.01■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.01■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SLC39A6Q13433 755 aa22■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RNF181Q9P0P0 153 aa22■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TJP1Q07157 1748 aa22■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y TM4SF1P30408 202 aa21.99■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RNMTO43148 476 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.97■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y SCN11AQ9UI33 1791 aa21.96■■□□□ 1.11
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NFIXQ14938 502 aa21.95■■□□□ 1.1
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CD99-211ENST00000623253_PAR_Y NARFQ9UHQ1 456 aa21.95■■□□□ 1.1
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