RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613541.1

STX4-217, Transcript of syntaxin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STX4, Length 649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4-217ENST00000613541 APLP1P51693 650 aa23.68■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 SMIM5Q71RC9 77 aa23.68■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 CARD14Q9BXL6 1004 aa23.68■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 ADRA2BP18089 450 aa23.67■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 ITPK1Q13572 414 aa23.67■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 ATG3Q9NT62 314 aa23.65■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.65■■□□□ 1.38
STX4-217ENST00000613541 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.64■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 BCS1LQ9Y276 419 aa23.64■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 TOMM70O94826 608 aa23.63■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa23.63■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.62■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 POLKQ9UBT6 870 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.61■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 RFC4P35249 363 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 DCAF5Q96JK2 942 aa23.6■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 A0A0G2JLW4 131 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.59■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 RPS6KA4O75676 772 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 FCHSD2O94868 740 aa23.58■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
STX4-217ENST00000613541 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.58■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 KDRP35968 1356 aa23.57■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.56■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 GYS1P13807 737 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 DPEP1P16444 411 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 CABP4P57796 275 aa23.55■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 PIM2Q9P1W9 311 aa23.54■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 C4AP0C0L4 1744 aa23.53■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 SLC4A9Q96Q91 983 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.52■■□□□ 1.36
STX4-217ENST00000613541 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.51■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 NMRK2Q9NPI5 230 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 KDM2BQ8NHM5 1336 aa23.5■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 MTHFSP49914 203 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 FSTL1Q12841 308 aa23.49■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.47■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.46■■□□□ 1.35
STX4-217ENST00000613541 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 KCNA3P22001 575 aa23.45■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 RNF181Q9P0P0 153 aa23.43■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.42■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 KLRG1Q96E93 195 aa23.42■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 ZPR1O75312 459 aa23.41■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 FKBP8Q14318 412 aa23.41■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 WDR90Q96KV7 1748 aa23.41■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
STX4-217ENST00000613541 DDR1Q08345 913 aa23.38■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 JMYQ8N9B5 988 aa23.38■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.38■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 TM4SF1P30408 202 aa23.37■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 MORC1Q86VD1 984 aa23.37■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 PANK3Q9H999 370 aa23.37■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 RRAGCQ9HB90 399 aa23.37■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.36■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.36■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 CHRNA5P30532 468 aa23.35■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 AKAP4Q5JQC9 854 aa23.34■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.34■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 SBF1O95248 1867 aa23.33■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
STX4-217ENST00000613541 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
STX4-217ENST00000613541 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.32■■□□□ 1.32
STX4-217ENST00000613541 LMNB1P20700 586 aa23.31■■□□□ 1.32
STX4-217ENST00000613541 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.31■■□□□ 1.32
STX4-217ENST00000613541 NARFQ9UHQ1 456 aa23.31■■□□□ 1.32
STX4-217ENST00000613541 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
STX4-217ENST00000613541 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.31■■□□□ 1.32
STX4-217ENST00000613541 TJP1Q07157 1748 aa23.3■■□□□ 1.32
STX4-217ENST00000613541 SCN11AQ9UI33 1791 aa23.3■■□□□ 1.32
STX4-217ENST00000613541 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms