RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612104.1

5S_rRNA.20-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 118 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa10.25□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 GNAT3A8MTJ3 354 aa10.24□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RIPK4P57078 832 aa10.24□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KCNQ3O43525 872 aa10.23□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 APBA3O96018 575 aa10.23□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PIGBQ92521 554 aa10.23□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LAMB4A4D0S4 1761 aa10.23□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KCNQ4P56696 695 aa10.22□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SLC39A6Q13433 755 aa10.22□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.22□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 DCAF5Q96JK2 942 aa10.22□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CAMKK2Q96RR4 588 aa10.22□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MIS18AQ9NYP9 233 aa10.22□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.22□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 BAG6P46379 1132 aa10.21□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.21□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.21□□□□□ -0.77
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.2□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 UBR3Q6ZT12 1888 aa10.2□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.2□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ATG3Q9NT62 314 aa10.2□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ZNF521Q96K83 1311 aa10.19□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CABP4P57796 275 aa10.19□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 WWC1Q8IX03 1113 aa10.19□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.19□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 C4AP0C0L4 1744 aa10.19□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 C4BP0C0L5 1744 aa10.19□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PALLDQ8WX93 1383 aa10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NEFMP07197 916 aa10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 KRT24Q2M2I5 525 aa10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PROM2Q8N271 834 aa10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TEFQ10587 303 aa10.17□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CDCA7LQ96GN5 454 aa10.17□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.17□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ITPK1Q13572 414 aa10.16□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SMIM5Q71RC9 77 aa10.16□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 BTBD11A6QL63 1104 aa10.15□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PLSCR1O15162 318 aa10.15□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ZNF853P0CG23 659 aa10.15□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CCDC27Q2M243 656 aa10.15□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.15□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 MBIPQ9NS73 344 aa10.15□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.15□□□□□ -0.78
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CASZ1Q86V15 1759 aa10.14□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.14□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TXNRD1Q16881 649 aa10.14□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ZNF790Q6PG37 636 aa10.14□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.13□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CHL1O00533 1208 aa10.13□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.13□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LINC00116Q8NCU8 138 aa10.13□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.13□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.13□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 BCORQ6W2J9 1755 aa10.12□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa10.12□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SIK1P57059 783 aa10.12□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ZNF827Q17R98 1081 aa10.12□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TSPYL6Q8N831 410 aa10.12□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.11□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CFAP44Q96MT7 982 aa10.11□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 IFT57Q9NWB7 429 aa10.11□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 CACNA1FO60840 1977 aa10.11□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ZBED9Q6R2W3 1325 aa10.1□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NUP98P52948 1817 aa10.1□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SCN7AQ01118 1682 aa10.1□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 ATP6V1AP38606 617 aa10.1□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 SLFN5Q08AF3 891 aa10.1□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 WDR63Q8IWG1 891 aa10.1□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.1□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 NECTIN2Q92692 538 aa10.1□□□□□ -0.79
5S_rRNA.20-201ENST00000612104 USP16Q9Y5T5 823 aa10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms