RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 FBLN1P23142 703 aa26.47■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.47■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.47■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 SPG7Q9UQ90 795 aa26.47■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 LINC00116Q8NCU8 138 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.46■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.45■■□□□ 1.83
SGMS1-208ENST00000608287 FYB1O15117 783 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 GGNBP2Q9H3C7 697 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 CARD14Q9BXL6 1004 aa26.44■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.44■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 KIF20BQ96Q89 1820 aa26.44■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.43■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 ATP6V1AP38606 617 aa26.43■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 FCHSD2O94868 740 aa26.42■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 ADRA2BP18089 450 aa26.42■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa26.42■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 TNS4Q8IZW8 715 aa26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.824e-7■■■■□ 25.8
SGMS1-208ENST00000608287 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.41■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 A0A0G2JLW4 131 aa26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 PRELPP51888 382 aa26.39■■□□□ 1.82
SGMS1-208ENST00000608287 SMIM5Q71RC9 77 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 C4AP0C0L4 1744 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 NCAPD2Q15021 1401 aa26.37■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.36■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 CAPN15O75808 1086 aa26.35■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 DPEP1P16444 411 aa26.35■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 ITPK1Q13572 414 aa26.35■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.35■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.34■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 PIM2Q9P1W9 311 aa26.34■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 ASAP1Q9ULH1 1129 aa26.34■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 RFC4P35249 363 aa26.33■■□□□ 1.81
SGMS1-208ENST00000608287 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 PANK3Q9H999 370 aa26.32■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.3■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.3■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 ATG3Q9NT62 314 aa26.29■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 RNF181Q9P0P0 153 aa26.29■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.29■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 KDRP35968 1356 aa26.29■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 PHKG2P15735 406 aa26.28■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 HTRA3P83110 453 aa26.28■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 DCAF5Q96JK2 942 aa26.28■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 GYS1P13807 737 aa26.27■■□□□ 1.8
SGMS1-208ENST00000608287 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 RPS6KA4O75676 772 aa26.26■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa26.25■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 RRAGCQ9HB90 399 aa26.25■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.24■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 ERVV-2B6SEH9 535 aa26.24■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa26.24■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 KCNA3P22001 575 aa26.22■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 SBF1O95248 1867 aa26.21■■□□□ 1.79
SGMS1-208ENST00000608287 EYA1Q99502 592 aa26.2■■□□□ 1.78
SGMS1-208ENST00000608287 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-208ENST00000608287 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-208ENST00000608287 KNSTRNQ9Y448 316 aa26.19■■□□□ 1.78
SGMS1-208ENST00000608287 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SGMS1-208ENST00000608287 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SGMS1-208ENST00000608287 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
SGMS1-208ENST00000608287 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.14■■□□□ 1.78
SGMS1-208ENST00000608287 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 GLTPD2A6NH11 291 aa26.13■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 LMNB1P20700 586 aa26.13■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 POLKQ9UBT6 870 aa26.13■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 CABP4P57796 275 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 MORC1Q86VD1 984 aa26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 CHRNA5P30532 468 aa26.09■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 FKBP8Q14318 412 aa26.09■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.09■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 ZPR1O75312 459 aa26.08■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 DDR1Q08345 913 aa26.08■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
SGMS1-208ENST00000608287 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.06■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
SGMS1-208ENST00000608287 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.05■■□□□ 1.76
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