RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 ZBTB7AO95365 584 aa23.08■■□□□ 1.29
HERC3-214ENST00000601319 SIK1P57059 783 aa23.08■■□□□ 1.29
HERC3-214ENST00000601319 POTEDQ86YR6 584 aa23.08■■□□□ 1.29
HERC3-214ENST00000601319 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa23.08■■□□□ 1.29
HERC3-214ENST00000601319 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.07■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 NUDCQ9Y266 331 aa23.07■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 PTGER2P43116 358 aa23.06■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 CABP4P57796 275 aa23.06■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.05■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 RSPH6AQ9H0K4 717 aa23.04■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 MAP3K5Q99683 1374 aa23.03■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.03■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 DLG5Q8TDM6 1919 aa23.02■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.02■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HERC3-214ENST00000601319 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 ITPK1Q13572 414 aa23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 RALBP1Q15311 655 aa23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 C4AP0C0L4 1744 aa23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.01■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 PRKAR2BP31323 418 aa23■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 ATP6V1AP38606 617 aa23■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 AK7Q96M32 723 aa23■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 LGR6Q9HBX8 967 aa22.99■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 FCHSD2O94868 740 aa22.98■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.98■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.97■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 SSFA2P28290 1259 aa22.96■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.96■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa22.96■■□□□ 1.27
HERC3-214ENST00000601319 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.95■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.94■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 ARXQ96QS3 562 aa22.93■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 GNPATO15228 680 aa22.92■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 POLD1P28340 1107 aa22.92■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 MSH5O43196 834 aa22.91■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 IL17REQ8NFR9 667 aa22.91■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
HERC3-214ENST00000601319 TEFQ10587 303 aa22.89■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 PHF14O94880 888 aa22.88■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 ADRA2BP18089 450 aa22.88■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.87■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.87■■□□□ 1.25
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HERC3-214ENST00000601319 SLC39A6Q13433 755 aa22.86■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 SYT17Q9BSW7 474 aa22.86■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 RPS6KA4O75676 772 aa22.85■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.85■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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HERC3-214ENST00000601319 NEFMP07197 916 aa22.84■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 MSL1Q68DK7 614 aa22.84■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 ZNF790Q6PG37 636 aa22.83■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 SMIM5Q71RC9 77 aa22.83■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.83■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
HERC3-214ENST00000601319 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.82■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.82■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 HEG1Q9ULI3 1381 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 SCN7AQ01118 1682 aa22.81■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.8■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.8■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 NFE2L2Q16236 605 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 MCM10Q7L590 875 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.79■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 CHD4Q14839 1912 aa22.78■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.77■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 BTBD11A6QL63 1104 aa22.77■■□□□ 1.24
HERC3-214ENST00000601319 BCORQ6W2J9 1755 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 RFC4P35249 363 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 COL15A1P39059 1388 aa22.76■■□□□ 1.23
HERC3-214ENST00000601319 GYS1P13807 737 aa22.75■■□□□ 1.23
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