RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600201.5

FCHO1-231, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-231ENST00000600201 TJP1Q07157 1748 aa20.35■□□□□ 0.85
FCHO1-231ENST00000600201 AK7Q96M32 723 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF831Q5JPB2 1677 aa20.34■□□□□ 0.85
FCHO1-231ENST00000600201 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-231ENST00000600201 KNSTRNQ9Y448 316 aa20.33■□□□□ 0.85
FCHO1-231ENST00000600201 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 IL13P35225 146 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 GPR162Q16538 588 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.32■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 ATP6V1AP38606 617 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.31■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 GNPATO15228 680 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 WWC3Q9ULE0 1092 aa20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.28■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.27■□□□□ 0.84
FCHO1-231ENST00000600201 MTHFSP49914 203 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 DCAF5Q96JK2 942 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.26■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 ERVV-2B6SEH9 535 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 HMOX1P09601 288 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 SSFA2P28290 1259 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 FLAD1Q8NFF5 587 aa20.25■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 CABP4P57796 275 aa20.23■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 LGR6Q9HBX8 967 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 MRC1P22897 1456 aa20.22■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
FCHO1-231ENST00000600201 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.2■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 KCPQ6ZWJ8 1503 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 CD2APQ9Y5K6 639 aa20.19■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa20.18■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 MMP10P09238 476 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 PXDNLA1KZ92 1463 aa20.17■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 SLC39A6Q13433 755 aa20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 CRKLP46109 303 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.15■□□□□ 0.82
FCHO1-231ENST00000600201 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 RNMTO43148 476 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 RPS6KA4O75676 772 aa20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 GYS1P13807 737 aa20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 TRAPPC3LQ5T215 181 aa20.14■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.13■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 SLC52A2Q9HAB3 445 aa20.13■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.12■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 ATP10DQ9P241 1426 aa20.11■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 GRIN3BO60391 1043 aa20.1■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 ADCY9O60503 1353 aa20.09■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 RFC4P35249 363 aa20.09■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 FKBP8Q14318 412 aa20.09■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 DDR1Q08345 913 aa20.08■□□□□ 0.81
FCHO1-231ENST00000600201 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.07■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 A0A0G2JLW4 131 aa20.07■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 ADRA2BP18089 450 aa20.07■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 C1QTNF8P60827 252 aa20.06■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 DPEP1P16444 411 aa20.05■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.05■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa20.05■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 NRXN2Q9P2S2 1712 aa20.05■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 IL17REQ8NFR9 667 aa20.04■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.04■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 CCDC87Q9NVE4 849 aa20.04■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 DLG5Q8TDM6 1919 aa20.03■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 SCN7AQ01118 1682 aa20.03■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.02■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 KCNA3P22001 575 aa20.02■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 USPL1Q5W0Q7 1092 aa20.02■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 RSPH6AQ9H0K4 717 aa20.02■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.02■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 COL15A1P39059 1388 aa20.02■□□□□ 0.8
FCHO1-231ENST00000600201 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms