RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595749.1

FCHO1-211, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-211ENST00000595749 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 NMRK2Q9NPI5 230 aa16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 TMOD3Q9NYL9 352 aa16.31■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.3■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa16.29■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 TMF1P82094 1093 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 NLGN1Q8N2Q7 840 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 C4AP0C0L4 1744 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa16.28■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 FCHSD2O94868 740 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 TRAPPC3LQ5T215 181 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 ATG3Q9NT62 314 aa16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.2
FCHO1-211ENST00000595749 DPEP1P16444 411 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 IFNL2Q8IZJ0 200 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 CCDC87Q9NVE4 849 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 ZNF831Q5JPB2 1677 aa16.26■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 PHKG2P15735 406 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 KLRG1Q96E93 195 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 EYA1Q99502 592 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 KDRP35968 1356 aa16.25■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 HTRA3P83110 453 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 C9orf131Q5VYM1 1079 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 JMYQ8N9B5 988 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa16.24■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 GYS1P13807 737 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 ADRA2BP18089 450 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 FSTL1Q12841 308 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.23■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 WASHC2AQ641Q2 1341 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 KCNA3P22001 575 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 RFC4P35249 363 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 SLC4A9Q96Q91 983 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 CARD14Q9BXL6 1004 aa16.22■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 KCPQ6ZWJ8 1503 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 RPS6KA4O75676 772 aa16.21■□□□□ 0.19
FCHO1-211ENST00000595749 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 CDCA8Q53HL2 280 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 PIM2Q9P1W9 311 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 SBF1O95248 1867 aa16.2■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 DCAF5Q96JK2 942 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 RRAGCQ9HB90 399 aa16.19■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 CAPN15O75808 1086 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 RNF181Q9P0P0 153 aa16.18■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 TNS4Q8IZW8 715 aa16.17■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 POLKQ9UBT6 870 aa16.16■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.15■□□□□ 0.18
FCHO1-211ENST00000595749 PRELPP51888 382 aa16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 CHRNA5P30532 468 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 CRKLP46109 303 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 CABP4P57796 275 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 DDR1Q08345 913 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 FKBP8Q14318 412 aa16.13■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 TJP1Q07157 1748 aa16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa16.11■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 TM4SF1P30408 202 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 RASSF7Q02833 373 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 AMOTQ4VCS5 1084 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.09■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
FCHO1-211ENST00000595749 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 MTHFSP49914 203 aa16.08■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 GLTPD2A6NH11 291 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 TIAM2Q8IVF5 1701 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 DLEC1Q9Y238 1755 aa16.07■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 ZPR1O75312 459 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 LMNB1P20700 586 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 C1orf141Q5JVX7 400 aa16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
FCHO1-211ENST00000595749 SCN11AQ9UI33 1791 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.4 ms