RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 BCS1LQ9Y276 419 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-211ENST00000592658 KIF20BQ96Q89 1820 aa18.55■□□□□ 0.56
CTIF-211ENST00000592658 A0A0G2JLW4 131 aa18.54■□□□□ 0.56
CTIF-211ENST00000592658 HTRA3P83110 453 aa18.54■□□□□ 0.56
CTIF-211ENST00000592658 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
CTIF-211ENST00000592658 SLC24A1O60721 1099 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-211ENST00000592658 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-211ENST00000592658 ASAP1Q9ULH1 1129 aa18.52■□□□□ 0.56
CTIF-211ENST00000592658 ATP6V1AP38606 617 aa18.51■□□□□ 0.55
CTIF-211ENST00000592658 DPEP1P16444 411 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-211ENST00000592658 FSTL1Q12841 308 aa18.5■□□□□ 0.55
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CTIF-211ENST00000592658 TMF1P82094 1093 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-211ENST00000592658 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.49■□□□□ 0.55
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CTIF-211ENST00000592658 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
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CTIF-211ENST00000592658 EYA1Q99502 592 aa18.42■□□□□ 0.54
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CTIF-211ENST00000592658 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-211ENST00000592658 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.42■□□□□ 0.54
CTIF-211ENST00000592658 PIM2Q9P1W9 311 aa18.41■□□□□ 0.54
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CTIF-211ENST00000592658 RNF181Q9P0P0 153 aa18.4■□□□□ 0.54
CTIF-211ENST00000592658 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.4■□□□□ 0.54
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CTIF-211ENST00000592658 ERVV-2B6SEH9 535 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-211ENST00000592658 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CTIF-211ENST00000592658 DDR1Q08345 913 aa18.36■□□□□ 0.53
CTIF-211ENST00000592658 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
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CTIF-211ENST00000592658 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CTIF-211ENST00000592658 CHRNA5P30532 468 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-211ENST00000592658 FKBP8Q14318 412 aa18.34■□□□□ 0.53
CTIF-211ENST00000592658 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
CTIF-211ENST00000592658 POLKQ9UBT6 870 aa18.33■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa18.32■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
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CTIF-211ENST00000592658 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
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CTIF-211ENST00000592658 TJP1Q07157 1748 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 GLTPD2A6NH11 291 aa18.29■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 LMNB1P20700 586 aa18.27■□□□□ 0.52
CTIF-211ENST00000592658 TIAM2Q8IVF5 1701 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 CABP4P57796 275 aa18.26■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 POTECB2RU33 542 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 NRXN2Q9P2S2 1712 aa18.25■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 AMOTQ4VCS5 1084 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 USPL1Q5W0Q7 1092 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.22■□□□□ 0.51
CTIF-211ENST00000592658 NFKBIEO00221 500 aa18.21■□□□□ 0.51
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