RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591574.5

CYTH1-216, Transcript of cytohesin 1, human

TSL 3

Gene CYTH1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CYTH1-216	ENST00000591574	ITPK1	Q13572	414 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		33.07	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		33.06	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	MTHFS	P49914	203 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	SMIM5	Q71RC9	77 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	KDR	P35968	1356 aa		33.05	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	SSFA2	P28290	1259 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	33.04	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	CHD4	Q14839	1912 aa		33.04	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	CABP4	P57796	275 aa		33.03	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	GNPAT	O15228	680 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	33.02	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	UTRN	P46939	3433 aa		33.02	■■■□□ 2.88
CYTH1-216	ENST00000591574	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		32.97	■■■□□ 2.87
CYTH1-216	ENST00000591574	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	32.95	■■■□□ 2.87
CYTH1-216	ENST00000591574	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		32.95	■■■□□ 2.87
CYTH1-216	ENST00000591574	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	HMOX1	P09601	288 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		32.94	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	32.93	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		32.93	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		32.92	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.92	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		32.91	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	32.9	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		32.89	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
CYTH1-216	ENST00000591574	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	32.88	■■■□□ 2.85
CYTH1-216	ENST00000591574	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	32.88	■■■□□ 2.85
CYTH1-216	ENST00000591574	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		32.87	■■■□□ 2.85
CYTH1-216	ENST00000591574	GRIN3B	O60391	1043 aa		32.86	■■■□□ 2.85
CYTH1-216	ENST00000591574	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	32.86	■■■□□ 2.85
CYTH1-216	ENST00000591574	ADRA2B	P18089	450 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CYTH1-216	ENST00000591574	LGR6	Q9HBX8	967 aa		32.84	■■■□□ 2.85
CYTH1-216	ENST00000591574	RPS6KA4	O75676	772 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CYTH1-216	ENST00000591574	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		32.83	■■■□□ 2.85
CYTH1-216	ENST00000591574	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	32.82	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	MMP10	P09238	476 aa		32.81	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	32.8	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	32.8	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	RFC4	P35249	363 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		32.79	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	32.79	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	32.78	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	TJP1	Q07157	1748 aa		32.77	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	MRC1	P22897	1456 aa		32.76	■■■□□ 2.84
CYTH1-216	ENST00000591574	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	32.74	■■■□□ 2.83
CYTH1-216	ENST00000591574	GYS1	P13807	737 aa		32.74	■■■□□ 2.83
CYTH1-216	ENST00000591574	SLC39A6	Q13433	755 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CYTH1-216	ENST00000591574	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CYTH1-216	ENST00000591574	C4A	P0C0L4	1744 aa		32.73	■■■□□ 2.83
CYTH1-216	ENST00000591574	CFAP53	Q96M91	514 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CYTH1-216	ENST00000591574	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		32.72	■■■□□ 2.83
CYTH1-216	ENST00000591574	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		32.71	■■■□□ 2.83
CYTH1-216	ENST00000591574	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.68	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		32.67	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		32.66	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	32.65	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.64	■■■□□ 2.82
CYTH1-216	ENST00000591574	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	PPP2R1A	P30153	589 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	TGFB2	P61812	414 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	NUDC	Q9Y266	331 aa		32.63	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	TEF	Q10587	303 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		32.62	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	FKBP8	Q14318	412 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		32.61	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	PRKAR2B	P31323	418 aa		32.6	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574		A0A0G2JLW4	131 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	ZPR1	O75312	459 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		32.59	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		32.58	■■■□□ 2.81
CYTH1-216	ENST00000591574	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		32.57	■■■□□ 2.8
CYTH1-216	ENST00000591574	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
CYTH1-216	ENST00000591574	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
CYTH1-216	ENST00000591574	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	32.56	■■■□□ 2.8
CYTH1-216	ENST00000591574	ATP10D	Q9P241	1426 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CYTH1-216	ENST00000591574	DPEP1	P16444	411 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CYTH1-216	ENST00000591574	C1QTNF8	P60827	252 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CYTH1-216	ENST00000591574	DDR1	Q08345	913 aa		32.55	■■■□□ 2.8
CYTH1-216	ENST00000591574	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		32.55	■■■□□ 2.8

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