RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590104.1

LAMA3-211, Transcript of laminin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 5

Gene LAMA3, Length 462 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3-211ENST00000590104 FAM83GA6ND36 823 aa9.66□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.66□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 TMUB1Q9BVT8 246 aa9.66□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.66□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 MYOM1P52179 1685 aa9.66□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 LAMC1P11047 1609 aa9.66□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa9.65□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 DNAJB2P25686 324 aa9.65□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 SYT17Q9BSW7 474 aa9.65□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.65□□□□□ -0.86
LAMA3-211ENST00000590104 C1orf167Q5SNV9 1468 aa9.65□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 SHANK3Q9BYB0 1731 aa9.65□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 PTGDRQ13258 359 aa9.64□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 E9PCH4 1651 aa9.64□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 RREB1Q92766 1687 aa9.64□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 ADGRB2O60241 1585 aa9.63□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 NUTM2FA1L443 756 aa9.62□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 ZBTB7AO95365 584 aa9.62□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 GPR162Q16538 588 aa9.62□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa9.62□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 NALCNQ8IZF0 1738 aa9.62□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.61□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 PARD3Q8TEW0 1356 aa9.61□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.6□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.6□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.6□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa9.6□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 RCCD1A6NED2 376 aa9.59□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 KMT5BQ4FZB7 885 aa9.59□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 METP08581 1390 aa9.59□□□□□ -0.87
LAMA3-211ENST00000590104 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 DLC1Q96QB1 1528 aa9.58□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 USP32Q8NFA0 1604 aa9.58□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 RNF223E7ERA6 249 aa9.58□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 FAM161AQ3B820 660 aa9.58□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 SIRT1Q96EB6 747 aa9.58□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 TLL1O43897 1013 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 CASZ1Q86V15 1759 aa9.57□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 PXDNQ92626 1479 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 FOXO3O43524 673 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 CFHP08603 1231 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 SLC19A1P41440 591 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 NPHP3Q7Z494 1330 aa9.56□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 FCHSD2O94868 740 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 CABLES1Q8TDN4 633 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.55□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 RGL3Q3MIN7 710 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 ATP10DQ9P241 1426 aa9.54□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 ABCC11Q96J66 1382 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF787Q6DD87 383 aa9.53□□□□□ -0.88
LAMA3-211ENST00000590104 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 SEMA3EO15041 775 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 S1PR4O95977 384 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 ANKLE1Q8NAG6 615 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 PCNTO95613 3336 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 CLTCL1P53675 1640 aa9.52□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 ROBO2Q9HCK4 1378 aa9.51□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 SLC10A3P09131 477 aa9.51□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 SPRYD7Q5W111 196 aa9.51□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 KIF1BO60333 1816 aa9.51□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.5□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 NR1I2O75469 434 aa9.5□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 OATP04181 439 aa9.5□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.5□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 BTG4Q9NY30 223 aa9.5□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.5□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.49□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa9.49□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 NRAPQ86VF7 1730 aa9.49□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 ADH1BP00325 375 aa9.49□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 PXYLP1Q8TE99 480 aa9.49□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 ARXQ96QS3 562 aa9.49□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.49□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 TECPR2O15040 1411 aa9.48□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 PSME1Q06323 249 aa9.48□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 PKDCCQ504Y2 493 aa9.48□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 STK26Q9P289 416 aa9.48□□□□□ -0.89
LAMA3-211ENST00000590104 HTRA3P83110 453 aa9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms