RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.32■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.31■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 CANXP27824 592 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa25.31■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 CRBNQ96SW2 442 aa25.3■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 TNNQ9UQP3 1299 aa25.29■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.28■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 EXOC5O00471 708 aa25.27■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 PDE3AQ14432 1141 aa25.27■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 VPS72Q15906 364 aa25.27■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.27■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.27■■□□□ 1.64
PGS1-211ENST00000589425 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 USP21Q9UK80 565 aa25.26■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 PANK1Q8TE04 598 aa25.25■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 MRC1P22897 1456 aa25.25■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 CABP4P57796 275 aa25.25■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 BARGINQ6ZT62 677 aa25.25■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.25■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 KIF16BQ96L93 1317 aa25.25■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 SLC39A6Q13433 755 aa25.24■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.24■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 RLBP1P12271 317 aa25.24■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 CLUAP1Q96AJ1 413 aa25.24■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 TRIM27P14373 513 aa25.23■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 ZNF790Q6PG37 636 aa25.23■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa25.23■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 DDB1Q16531 1140 aa25.21■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.21■■□□□ 1.63
PGS1-211ENST00000589425 COG6Q9Y2V7 657 aa25.2■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 TNS2Q63HR2 1409 aa25.2■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 SLC4A2P04920 1241 aa25.2■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 NECTIN2Q92692 538 aa25.2■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 AFF2P51816 1311 aa25.19■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 CCDC30Q5VVM6 783 aa25.18■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 ARHGAP45Q92619 1136 aa25.18■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 HOXB7P09629 217 aa25.18■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.18■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 MS4A1P11836 297 aa25.16■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa25.16■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.16■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.16■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 TTC5Q8N0Z6 440 aa25.15■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 STK31Q9BXU1 1019 aa25.15■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PGS1-211ENST00000589425 G2E3Q7L622 706 aa25.14■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.12■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 MVPQ14764 893 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 TMEM57Q8N5G2 664 aa25.12■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 PIGBQ92521 554 aa25.12■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.11■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.1■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 PTPRCP08575 1304 aa25.09■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.09■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 CHPF2Q9P2E5 772 aa25.08■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 ATRNO75882 1429 aa25.08■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 ABCC4O15439 1325 aa25.08■■□□□ 1.61
PGS1-211ENST00000589425 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.08■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 RGS12O14924 1447 aa25.07■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 GLI3P10071 1580 aa25.07■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 ITGB4P16144 1822 aa25.07■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 FLIIQ13045 1269 aa25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 ASAP1Q9ULH1 1129 aa25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 USP16Q9Y5T5 823 aa25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 A0A0G2JS52 829 aa25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 MYT1Q01538 1121 aa25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 BCL9O00512 1426 aa25.06■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 ANXA1P04083 346 aa25.05■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 PAPPAQ13219 1627 aa25.05■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 C5P01031 1676 aa25.05■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 ATG3Q9NT62 314 aa25.04■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
PGS1-211ENST00000589425 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.04■■□□□ 1.6
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