RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 AEBP1Q8IUX7 1158 aa24.94■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 SSFA2P28290 1259 aa24.93■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 GPR162Q16538 588 aa24.93■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 ATP6V1AP38606 617 aa24.92■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 UTRNP46939 3433 aa24.92■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 SULT6B1Q6IMI4 303 aa24.91■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 PHF14O94880 888 aa24.89■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.58
CTIF-206ENST00000588345 SMIM5Q71RC9 77 aa24.88■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.88■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.88■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 GNPATO15228 680 aa24.87■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 MTHFSP49914 203 aa24.86■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 CABP4P57796 275 aa24.86■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 C1orf141Q5JVX7 400 aa24.86■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 SCN11AQ9UI33 1791 aa24.85■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.84■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.83■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CTIF-206ENST00000588345 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa24.82■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 GRIN3BO60391 1043 aa24.81■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 AKAP4Q5JQC9 854 aa24.8■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.8■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 ADRA2BP18089 450 aa24.78■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.78■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 TJP1Q07157 1748 aa24.77■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 MRC1P22897 1456 aa24.77■■□□□ 1.56
CTIF-206ENST00000588345 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa24.76■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 RPS6KA4O75676 772 aa24.76■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 HMOX1P09601 288 aa24.76■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 C4AP0C0L4 1744 aa24.75■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 KIF13BQ9NQT8 1826 aa24.75■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.73■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 SLC52A2Q9HAB3 445 aa24.73■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 MMP10P09238 476 aa24.72■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 LGR6Q9HBX8 967 aa24.72■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 RNMTO43148 476 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 GYS1P13807 737 aa24.71■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
CTIF-206ENST00000588345 CRKLP46109 303 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.69■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 RFC4P35249 363 aa24.69■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.67■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.66■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.66■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.65■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 TGFB2P61812 414 aa24.64■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.64■■□□□ 1.54
CTIF-206ENST00000588345 SLC39A6Q13433 755 aa24.63■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 ADCY9O60503 1353 aa24.63■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 C1QTNF8P60827 252 aa24.62■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.62■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.61■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 VSIG10Q8N0Z9 540 aa24.6■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 GAS2L2Q8NHY3 880 aa24.6■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.6■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 ATP10DQ9P241 1426 aa24.6■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 FKBP8Q14318 412 aa24.58■■□□□ 1.53
CTIF-206ENST00000588345 GNAT3A8MTJ3 354 aa24.57■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 IL17REQ8NFR9 667 aa24.57■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 CFAP53Q96M91 514 aa24.57■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 A0A0G2JLW4 131 aa24.56■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 DDR1Q08345 913 aa24.55■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.55■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 DPEP1P16444 411 aa24.54■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 PPP2R1AP30153 589 aa24.54■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 TM4SF1P30408 202 aa24.54■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa24.54■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 COL15A1P39059 1388 aa24.54■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa24.54■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 ZPR1O75312 459 aa24.53■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 TEFQ10587 303 aa24.53■■□□□ 1.52
CTIF-206ENST00000588345 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.53■■□□□ 1.52
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