RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 NBPF15Q8N660 670 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 NLRP3Q96P20 1036 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 GOPCQ9HD26 462 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 H7C1W4 665 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 CLN3Q13286 438 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 CCDC125Q86Z20 511 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 DCAF5Q96JK2 942 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 PRXQ9BXM0 1461 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 ITGB2P05107 769 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 TRAK2O60296 914 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 RNF20Q5VTR2 975 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 CYP2U1Q7Z449 544 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 TRERF1Q96PN7 1200 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-212ENST00000580838 KIF27Q86VH2 1401 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 NCAPD3P42695 1498 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 MSTNO14793 375 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 THBS1P07996 1170 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 MX2P20592 715 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 NR1H3Q13133 447 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 WDR44Q5JSH3 913 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 SPOCK3Q9BQ16 436 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 WASLO00401 505 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 GPR37L1O60883 481 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 F11P03951 625 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 TAS1R3Q7RTX0 852 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 PODNQ7Z5L7 613 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 LRRC4BQ9NT99 713 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 RAB6BQ9NRW1 208 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 CUX2O14529 1486 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 MAP3K1Q13233 1512 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 OIP5O43482 229 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 ARAP1Q96P48 1450 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 IL2RAP01589 272 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 PROCP04070 461 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-212ENST00000580838 ADAM23O75077 832 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 GNRH1P01148 92 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 CENPCQ03188 943 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 IL27Q8NEV9 243 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 CNKSR1Q969H4 720 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 PRDM2Q13029 1718 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 PHKA2P46019 1235 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 MAP2K3P46734 347 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 GPAMQ9HCL2 828 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 CFTRP13569 1480 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 MTMR14Q8NCE2 650 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF592Q92610 1267 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 KLRG1Q96E93 195 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 CUX1P39880 1505 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 XAGE2Q96GT9 111 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 A0A1B0GTH6 734 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 BANK1Q8NDB2 785 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 KRBA1A5PL33 1030 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 SOCS7O14512 581 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 NEUROD2Q15784 382 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 XP32Q5T750 250 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 FHAD1B1AJZ9 1412 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRM-212ENST00000580838 MSX1P28360 303 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 C4orf17Q53FE4 359 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 RUBCNLQ9H714 662 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 SNRKQ9NRH2 765 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 PHF24Q9UPV7 400 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 COL8A1P27658 744 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRM-212ENST00000580838 GNASQ5JWF2 1037 aa8.26□□□□□ -1.09
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