RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574157.5

NOMO3-211, Transcript of NODAL modulator 3, human

TSL 3

Gene NOMO3, Length 821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NOMO3-211	ENST00000574157	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	11.71	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		11.71	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	TRIM37	O94972	964 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	IL2RB	P14784	551 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	EVA1C	P58658	441 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	GNAI1	P63096	354 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		11.7	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	APBA3	O96018	575 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	CFAP44	Q96MT7	982 aa		11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	YY1	P25490	414 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.68	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	CHL1	O00533	1208 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	PHKG2	P15735	406 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		11.67	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	CYP27B1	O15528	508 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	DCTN1	Q14203	1278 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	NBPF14	Q5TI25	921 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	MCM10	Q7L590	875 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	PAPPA	Q13219	1627 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF428	Q96B54	188 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	DCAF5	Q96JK2	942 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	MBIP	Q9NS73	344 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NOMO3-211	ENST00000574157	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	TEF	Q10587	303 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	BCL9	O00512	1426 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	LGR6	Q9HBX8	967 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	HOXB7	P09629	217 aa		11.6	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	POLA2	Q14181	598 aa		11.59	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		11.59	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	SPON1	Q9HCB6	807 aa		11.59	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	11.59	□□□□□ -0.55
NOMO3-211	ENST00000574157	EXOC5	O00471	708 aa		11.58	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	DDB1	Q16531	1140 aa		11.58	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		11.58	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		11.58	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	VAMP4	O75379	141 aa		11.57	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	11.57	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		11.57	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	NHS	Q6T4R5	1651 aa		11.56	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	ITGB4	P16144	1822 aa		11.56	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.56	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	KCNQ2	O43526	872 aa		11.56	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	11.56	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	TSPYL6	Q8N831	410 aa		11.56	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	11.56	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.56	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	C5	P01031	1676 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	NEFL	P07196	543 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF790	Q6PG37	636 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	11.55	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		11.55	□□□□□ -0.56
NOMO3-211	ENST00000574157	CABP4	P57796	275 aa		11.54	□□□□□ -0.56

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