RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 PHKG2P15735 406 aa36.96■■■■□ 3.51
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CARD10Q9BWT7 1032 aa36.94■■■■□ 3.5
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa36.94■■■■□ 3.5
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
CTDNEP1-208ENST00000573600 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa36.84■■■■□ 3.49
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CTDNEP1-208ENST00000573600 BTG4Q9NY30 223 aa36.81■■■■□ 3.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 G2E3Q7L622 706 aa36.8■■■■□ 3.48
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NECTIN2Q92692 538 aa36.76■■■■□ 3.48
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa36.73■■■■□ 3.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PIP4K2BP78356 416 aa36.73■■■■□ 3.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF790Q6PG37 636 aa36.73■■■■□ 3.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 SHANK3Q9BYB0 1731 aa36.72■■■■□ 3.47
CTDNEP1-208ENST00000573600 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP36.72■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP36.7■■■■□ 3.47
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PLCH1Q4KWH8 1693 aa36.67■■■■□ 3.46
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CTDNEP1-208ENST00000573600 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
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CTDNEP1-208ENST00000573600 CHPF2Q9P2E5 772 aa36.66■■■■□ 3.46
CTDNEP1-208ENST00000573600 ERVV-2B6SEH9 535 aa36.65■■■■□ 3.46
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CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf115Q9H7X2 142 aa36.62■■■■□ 3.45
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CTDNEP1-208ENST00000573600 PDE4AP27815 886 aa36.6■■■■□ 3.45
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GCC1Q96CN9 775 aa36.59■■■■□ 3.45
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CTDNEP1-208ENST00000573600 FMNL2Q96PY5 1086 aa36.58■■■■□ 3.45
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAMTS2O95450 1211 aa36.57■■■■□ 3.45
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CTDNEP1-208ENST00000573600 HYPKQ9NX55 129 aa36.56■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP36.55■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GNAI3P08754 354 aa36.52■■■■□ 3.44
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CTDNEP1-208ENST00000573600 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 LAMB4A4D0S4 1761 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM161AQ3B820 660 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 DNAAF4Q8WXU2 420 aa36.5■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 NUCB1Q02818 461 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa36.49■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 ANXA1P04083 346 aa36.48■■■■□ 3.43
CTDNEP1-208ENST00000573600 CEP85Q6P2H3 762 aa36.48■■■■□ 3.43
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