RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 CD2APQ9Y5K6 639 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 KDRP35968 1356 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 GNPATO15228 680 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 GRIN3BO60391 1043 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-211ENST00000568829 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 ADRA2BP18089 450 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 ITPK1Q13572 414 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 UTRNP46939 3433 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 NLGN2Q8NFZ4 835 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-211ENST00000568829 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 HMOX1P09601 288 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 CFAP53Q96M91 514 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 RFC4P35249 363 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 RPS6KA4O75676 772 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 CHD4Q14839 1912 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.34■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-211ENST00000568829 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 MMP10P09238 476 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 NUDCQ9Y266 331 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 SMIM5Q71RC9 77 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.163e-6■□□□□ 8.1
SPNS1-211ENST00000568829 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 TGFB2P61812 414 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 LGR6Q9HBX8 967 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-211ENST00000568829 TEFQ10587 303 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 GYS1P13807 737 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 ZPR1O75312 459 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 MRC1P22897 1456 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 STARD3NLO95772 234 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-211ENST00000568829 SLC39A6Q13433 755 aa22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 NEFMP07197 916 aa22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 PPP2R1AP30153 589 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 PRKAR2BP31323 418 aa22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 A0A087WZG4 1122 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 FCHSD2O94868 740 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 C1QTNF8P60827 252 aa22.16■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF790Q6PG37 636 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 NARFQ9UHQ1 456 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 BCS1LQ9Y276 419 aa22.15■■□□□ 1.14
SPNS1-211ENST00000568829 FKBP8Q14318 412 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 IL17REQ8NFR9 667 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 C4AP0C0L4 1744 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 TJP1Q07157 1748 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.14■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 COL15A1P39059 1388 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 A0A0G2JLW4 131 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS1-211ENST00000568829 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.13■■□□□ 1.13
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