RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568622.1

KIAA0556-208, Transcript of KIAA0556, humanhuman

TSL 2

Gene KIAA0556, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC4A9Q96Q91 983 aa15.42■□□□□ 0.06
KIAA0556-208ENST00000568622 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.42■□□□□ 0.06
KIAA0556-208ENST00000568622 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.41■□□□□ 0.06
KIAA0556-208ENST00000568622 PHF14O94880 888 aa15.41■□□□□ 0.06
KIAA0556-208ENST00000568622 ATP6V1AP38606 617 aa15.4■□□□□ 0.06
KIAA0556-208ENST00000568622 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
KIAA0556-208ENST00000568622 ERVV-2B6SEH9 535 aa15.39■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 GNPATO15228 680 aa15.39■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.39■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 DCAF5Q96JK2 942 aa15.38■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 C10orf71Q711Q0 1435 aa15.37■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.37■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 MMP10P09238 476 aa15.36■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 ADRA2BP18089 450 aa15.36■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 CEP350Q5VT06 3117 aa15.35■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 TGFB2P61812 414 aa15.34■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 NLGN1Q8N2Q7 840 aa15.34■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 PANK3Q9H999 370 aa15.34■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
KIAA0556-208ENST00000568622 RPS6KA4O75676 772 aa15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 GYS1P13807 737 aa15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 TRAPPC3LQ5T215 181 aa15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 C4AP0C0L4 1744 aa15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 KIF3CO14782 793 aa15.32■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 HSPA6P17066 643 aa15.31■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.31■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 WWC3Q9ULE0 1092 aa15.31■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa15.31■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 TJP1Q07157 1748 aa15.3■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 KCNA3P22001 575 aa15.29■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 IL13P35225 146 aa15.29■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 CABP4P57796 275 aa15.29■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 MRC1P22897 1456 aa15.28■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 A0A0G2JLW4 131 aa15.28■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 POLR3GLQ9BT43 218 aa15.28■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 SCN11AQ9UI33 1791 aa15.27■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 MTHFSP49914 203 aa15.27■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.27■□□□□ 0.04
KIAA0556-208ENST00000568622 DPEP1P16444 411 aa15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 RFC4P35249 363 aa15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 MORC1Q86VD1 984 aa15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.26■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 BCS1LQ9Y276 419 aa15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 PARP3Q9Y6F1 533 aa15.25■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 DDR1Q08345 913 aa15.24■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 TM4SF1P30408 202 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 FKBP8Q14318 412 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 AKAP4Q5JQC9 854 aa15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 KCPQ6ZWJ8 1503 aa15.22■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.22■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.22■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 TOMM70O94826 608 aa15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 FCHSD2O94868 740 aa15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.21■□□□□ 0.03
KIAA0556-208ENST00000568622 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.2■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.2■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa15.2■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.2■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 LGR6Q9HBX8 967 aa15.2■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 PIM2Q9P1W9 311 aa15.2■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 NMRK2Q9NPI5 230 aa15.19■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 KIF7Q2M1P5 1343 aa15.18■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.18■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 UBR2Q8IWV8 1755 aa15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 APLP1P51693 650 aa15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 C9orf131Q5VYM1 1079 aa15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 USPL1Q5W0Q7 1092 aa15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 VSIG10Q8N0Z9 540 aa15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 BCL2L12Q9HB09 334 aa15.17■□□□□ 0.02
KIAA0556-208ENST00000568622 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms