RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-208ENST00000564966 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP34.42■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 ERVV-2B6SEH9 535 aa34.41■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 CABP4P57796 275 aa34.41■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 SMIM5Q71RC9 77 aa34.41■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP34.4■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 MTHFSP49914 203 aa34.4■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 NLGN2Q8NFZ4 835 aa34.4■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 GNPATO15228 680 aa34.39■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 IL13P35225 146 aa34.39■■■■□ 3.1
PPP4C-208ENST00000564966 ITPK1Q13572 414 aa34.38■■■■□ 3.09
PPP4C-208ENST00000564966 AMIGO3Q86WK7 504 aa34.36■■■■□ 3.09
PPP4C-208ENST00000564966 SSFA2P28290 1259 aa34.35■■■■□ 3.09
PPP4C-208ENST00000564966 UBR3Q6ZT12 1888 aa34.35■■■■□ 3.09
PPP4C-208ENST00000564966 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP34.33■■■■□ 3.09
PPP4C-208ENST00000564966 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 HMOX1P09601 288 aa34.31■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 KDRP35968 1356 aa34.3■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 UTRNP46939 3433 aa34.29■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP34.28■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa34.28■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 CHD4Q14839 1912 aa34.28■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 CD2APQ9Y5K6 639 aa34.26■■■■□ 3.08
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
PPP4C-208ENST00000564966 SLC4A9Q96Q91 983 aa34.25■■■■□ 3.07
PPP4C-208ENST00000564966 AKAP4Q5JQC9 854 aa34.24■■■■□ 3.07
PPP4C-208ENST00000564966 TRAPPC3LQ5T215 181 aa34.24■■■■□ 3.07
PPP4C-208ENST00000564966 GRIN3BO60391 1043 aa34.21■■■■□ 3.07
PPP4C-208ENST00000564966 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
PPP4C-208ENST00000564966 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP34.2■■■■□ 3.072e-9■■□□□ 12.9
PPP4C-208ENST00000564966 RFC4P35249 363 aa34.17■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa34.17■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 SCN11AQ9UI33 1791 aa34.16■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 ZNF831Q5JPB2 1677 aa34.16■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa34.16■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 LGR6Q9HBX8 967 aa34.16■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 WWC3Q9ULE0 1092 aa34.16■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 MMP10P09238 476 aa34.15■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP34.15■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP34.14■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 ADRA2BP18089 450 aa34.14■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP34.14■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 SLC52A2Q9HAB3 445 aa34.14■■■■□ 3.06
PPP4C-208ENST00000564966 RPS6KA4O75676 772 aa34.13■■■■□ 3.05
PPP4C-208ENST00000564966 RNMTO43148 476 aaKnown RBP34.12■■■■□ 3.05
PPP4C-208ENST00000564966 NLGN1Q8N2Q7 840 aa34.12■■■■□ 3.05
PPP4C-208ENST00000564966 CRKLP46109 303 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
PPP4C-208ENST00000564966 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
PPP4C-208ENST00000564966 CFAP53Q96M91 514 aa34.09■■■■□ 3.05
PPP4C-208ENST00000564966 SLC39A6Q13433 755 aa34.08■■■■□ 3.05
PPP4C-208ENST00000564966 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP34.05■■■■□ 3.04
PPP4C-208ENST00000564966 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-208ENST00000564966 GYS1P13807 737 aa34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-208ENST00000564966 DNAJC10Q8IXB1 793 aa34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-208ENST00000564966 PARP3Q9Y6F1 533 aa34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-208ENST00000564966 TJP1Q07157 1748 aa34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-208ENST00000564966 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP34.04■■■■□ 3.04
PPP4C-208ENST00000564966 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP34.03■■■■□ 3.04
PPP4C-208ENST00000564966 GAS2L2Q8NHY3 880 aa34.01■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 CCDC87Q9NVE4 849 aa34.01■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP34.01■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 MRC1P22897 1456 aa34.01■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 TTC5Q8N0Z6 440 aa34■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 C4AP0C0L4 1744 aa33.99■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 TEFQ10587 303 aa33.99■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 GNAT3A8MTJ3 354 aa33.98■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 NUDCQ9Y266 331 aa33.98■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 ZPR1O75312 459 aa33.95■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP33.95■■■■□ 3.03
PPP4C-208ENST00000564966 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 PPP2R1AP30153 589 aa33.94■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 PRKAR2BP31323 418 aa33.94■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 A0A0G2JLW4 131 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 TGFB2P61812 414 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 FKBP8Q14318 412 aa33.93■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 KCPQ6ZWJ8 1503 aa33.92■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa33.92■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 PXDNLA1KZ92 1463 aa33.91■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 C10orf71Q711Q0 1435 aa33.91■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 BCS1LQ9Y276 419 aa33.91■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP33.9■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 USPL1Q5W0Q7 1092 aa33.9■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 IL17REQ8NFR9 667 aa33.9■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP33.89■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 VSIG10Q8N0Z9 540 aa33.89■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa33.89■■■■□ 3.02
PPP4C-208ENST00000564966 ATP10DQ9P241 1426 aa33.88■■■■□ 3.01
PPP4C-208ENST00000564966 DPEP1P16444 411 aa33.88■■■■□ 3.01
PPP4C-208ENST00000564966 CANXP27824 592 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
PPP4C-208ENST00000564966 PHACTR3Q96KR7 559 aa33.88■■■■□ 3.01
PPP4C-208ENST00000564966 KIF13BQ9NQT8 1826 aa33.88■■■■□ 3.01
PPP4C-208ENST00000564966 STARD3NLO95772 234 aa33.87■■■■□ 3.01
PPP4C-208ENST00000564966 C1QTNF8P60827 252 aa33.87■■■■□ 3.01
PPP4C-208ENST00000564966 RSPH6AQ9H0K4 717 aa33.87■■■■□ 3.01
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