RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561105.1

PDE8A-215, Transcript of phosphodiesterase 8A, human

TSL 2

Gene PDE8A, Length 191 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE8A-215	ENST00000561105	XAGE2	Q96GT9	111 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE8A-215	ENST00000561105	ZFP42	Q96MM3	310 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE8A-215	ENST00000561105	NLRP3	Q96P20	1036 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE8A-215	ENST00000561105	ARX	Q96QS3	562 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE8A-215	ENST00000561105	HINFP	Q9BQA5	517 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE8A-215	ENST00000561105	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PDE8A-215	ENST00000561105	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
PDE8A-215	ENST00000561105	FAM196B	A6NMK8	535 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SEC13	P55735	322 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SCARF1	Q14162	830 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	ZNF358	Q9NW07	568 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SOBP	A7XYQ1	873 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	POTEC	B2RU33	542 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SPINT1	O43278	529 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SIX5	Q8N196	739 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SMTN	P53814	917 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	POU4F2	Q12837	409 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	CLN3	Q13286	438 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	RETREG2	Q8NC44	543 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	HRH3	Q9Y5N1	445 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	USP3	Q9Y6I4	520 aa		5	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105		A6NJY4	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	BACH1	O14867	736 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	RHOQ	P17081	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	PHKA2	P46019	1235 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	GRIP2	Q9C0E4	1043 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	TTLL8	A6PVC2	850 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	PRMT3	O60678	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	TLR1	Q15399	786 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	CDK2AP1	O14519	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SCNN1A	P37088	669 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDE8A-215	ENST00000561105	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	WASL	O00401	505 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	C21orf2	O43822	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	MAN1A2	O60476	641 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	EPHA4	P54764	986 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	MTFR1	Q15390	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	RNF217	Q8TC41	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	AIDA	Q96BJ3	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105		M0R2N6	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	FOXK2	Q01167	660 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	C4orf17	Q53FE4	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	WEE1	P30291	646 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	GPC1	P35052	558 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	NOS2	P35228	1153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	SENP2	Q9HC62	589 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	ATP2B4	P23634	1241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	OCLN	Q16625	522 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDE8A-215	ENST00000561105	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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