RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561037.5

MIR9-3HG-211, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MIR9-3HG, Length 779 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-211ENST00000561037 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.53□□□□□ -0.88
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PRDM11Q9NQV5 511 aa9.53□□□□□ -0.88
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
MIR9-3HG-211ENST00000561037 EVA1CP58658 441 aa9.52□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.51□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NBPF26B4DH59 902 aa9.51□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NEUROD1Q13562 356 aa9.51□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.51□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ABTB2Q8N961 1025 aa9.51□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ACEP12821 1306 aa9.51□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 GLI3P10071 1580 aa9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NUTM2GQ5VZR2 741 aa9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 EYA1Q99502 592 aa9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 STRN4Q9NRL3 753 aa9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TSKSQ9UJT2 592 aa9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ITSN1Q15811 1721 aa9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ERBB3P21860 1342 aa9.5□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PLCH1Q4KWH8 1693 aa9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NWD2Q9ULI1 1742 aa9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 RCCD1A6NED2 376 aa9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 BAG6P46379 1132 aa9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 DIXDC1Q155Q3 683 aa9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NLRP13Q86W25 1043 aa9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TATDN2Q93075 761 aa9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 KCNK17Q96T54 332 aa9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.49□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ATP7BP35670 1465 aa9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 CHRNA2Q15822 529 aa9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 SH3D19Q5HYK7 790 aa9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PNMA3Q9UL41 463 aa9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.48□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ZBTB7CA1YPR0 619 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 DNAJB2P25686 324 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 SULF1Q8IWU6 871 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NLRP7Q8WX94 980 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 SIN3AQ96ST3 1273 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 USP35Q9P2H5 1018 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 EVC2Q86UK5 1308 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ABCA3Q99758 1704 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 KIAA0232Q92628 1395 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa9.47□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ALS2Q96Q42 1657 aa9.46□□□□□ -0.89
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ARHGAP33O14559 1287 aa9.46□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PDE3BQ13370 1112 aa9.46□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 CABP1Q9NZU7 370 aa9.45□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 GCP02774 474 aa9.44□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 FAM182BQ5T319 152 aa9.44□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa9.44□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.43□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PBX2P40425 430 aa9.43□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 FLIIQ13045 1269 aa9.43□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.43□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.43□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 SLC4A5Q9BY07 1137 aa9.43□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.43□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 NRAPQ86VF7 1730 aa9.42□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PROX2Q3B8N5 592 aa9.42□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TCP11L2Q8N4U5 519 aa9.42□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.42□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 ST18O60284 1047 aa9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 EMP3P54852 163 aa9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 KCNH5Q8NCM2 988 aa9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 CARD11Q9BXL7 1154 aa9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 QRICH2Q9H0J4 1663 aa9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 SSH2Q76I76 1423 aa9.4□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 CPDO75976 1380 aa9.4□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TONSLQ96HA7 1378 aa9.4□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 USP19O94966 1318 aa9.4□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.4□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 TRIM37O94972 964 aa9.4□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 APBA3O96018 575 aa9.4□□□□□ -0.9
MIR9-3HG-211ENST00000561037 PSEN2P49810 448 aa9.4□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms