RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP27.09■■□□□ 1.93
RABGGTA-210ENST00000559586 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa27.09■■□□□ 1.93
RABGGTA-210ENST00000559586 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
RABGGTA-210ENST00000559586 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.08■■□□□ 1.93
RABGGTA-210ENST00000559586 PHKG2P15735 406 aa27.07■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.06■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.05■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.04■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 PHF14O94880 888 aa27.04■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 PPP2R1AP30153 589 aa27.04■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 KDRP35968 1356 aa27.04■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP6V1AP38606 617 aa27.03■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.03■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 LINC00116Q8NCU8 138 aa27.02■■□□□ 1.92
RABGGTA-210ENST00000559586 UBR3Q6ZT12 1888 aa27■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 ERVV-2B6SEH9 535 aa27■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 GNPATO15228 680 aa26.99■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 SULT6B1Q6IMI4 303 aa26.99■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.99■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 ATG3Q9NT62 314 aa26.99■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 DCAF5Q96JK2 942 aa26.98■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 ITPK1Q13572 414 aa26.97■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.97■■□□□ 1.91
RABGGTA-210ENST00000559586 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 TRAPPC3LQ5T215 181 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 SMIM5Q71RC9 77 aa26.93■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 ADRA2BP18089 450 aa26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 HMOX1P09601 288 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 NLGN1Q8N2Q7 840 aa26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 ATP10DQ9P241 1426 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 CABP4P57796 275 aa26.9■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.89■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 MMP10P09238 476 aa26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 RALBP1Q15311 655 aa26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CFAP53Q96M91 514 aa26.88■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa26.87■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 TGFB2P61812 414 aa26.86■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ADCY9O60503 1353 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 RPS6KA4O75676 772 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 RFC4P35249 363 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.84■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RABGGTA-210ENST00000559586 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.81■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.8■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 PARP3Q9Y6F1 533 aa26.8■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.79■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.79■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 NUDCQ9Y266 331 aa26.79■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 GYS1P13807 737 aa26.78■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.77■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.88
RABGGTA-210ENST00000559586 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.76■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.76■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.75■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 PRKAR2BP31323 418 aa26.74■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 BCS1LQ9Y276 419 aa26.74■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP350Q5VT06 3117 aa26.73■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A0G2JLW4 131 aa26.73■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 FCHSD2O94868 740 aa26.72■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 LGR6Q9HBX8 967 aa26.71■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 C4AP0C0L4 1744 aa26.7■■□□□ 1.87
RABGGTA-210ENST00000559586 HSPA6P17066 643 aa26.7■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 DPEP1P16444 411 aa26.69■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.69■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 MRC1P22897 1456 aa26.68■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.68■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 RNMTO43148 476 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.67■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.66■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 PIM2Q9P1W9 311 aa26.66■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 ZPR1O75312 459 aa26.65■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
RABGGTA-210ENST00000559586 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.65■■□□□ 1.86
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