RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557569.1

CKB-217, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 2

Gene CKB, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-217ENST00000557569 PXDNLA1KZ92 1463 aa36.51■■■■□ 3.44
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CKB-217ENST00000557569 POLKQ9UBT6 870 aa36.51■■■■□ 3.44
CKB-217ENST00000557569 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP36.51■■■■□ 3.43
CKB-217ENST00000557569 SLC4A9Q96Q91 983 aa36.49■■■■□ 3.43
CKB-217ENST00000557569 KDRP35968 1356 aa36.49■■■■□ 3.43
CKB-217ENST00000557569 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa36.45■■■■□ 3.43
CKB-217ENST00000557569 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP36.45■■■■□ 3.43
CKB-217ENST00000557569 A0A0G2JLW4 131 aa36.42■■■■□ 3.42
CKB-217ENST00000557569 KIF13BQ9NQT8 1826 aa36.41■■■■□ 3.42
CKB-217ENST00000557569 C10orf71Q711Q0 1435 aa36.41■■■■□ 3.42
CKB-217ENST00000557569 TRAPPC3LQ5T215 181 aa36.4■■■■□ 3.42
CKB-217ENST00000557569 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP36.4■■■■□ 3.42
CKB-217ENST00000557569 TGFB2P61812 414 aa36.39■■■■□ 3.42
CKB-217ENST00000557569 BCS1LQ9Y276 419 aa36.39■■■■□ 3.42
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CKB-217ENST00000557569 NLGN1Q8N2Q7 840 aa36.37■■■■□ 3.41
CKB-217ENST00000557569 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
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CKB-217ENST00000557569 GYS1P13807 737 aa36.35■■■■□ 3.41
CKB-217ENST00000557569 DPEP1P16444 411 aa36.35■■■■□ 3.41
CKB-217ENST00000557569 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
CKB-217ENST00000557569 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa36.34■■■■□ 3.41
CKB-217ENST00000557569 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa36.33■■■■□ 3.41
CKB-217ENST00000557569 ADRA2BP18089 450 aa36.32■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa36.32■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 ZNF831Q5JPB2 1677 aa36.32■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 DCAF5Q96JK2 942 aa36.31■■■■□ 3.4
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CKB-217ENST00000557569 C4AP0C0L4 1744 aa36.3■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 NMRK2Q9NPI5 230 aa36.29■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 CCDC87Q9NVE4 849 aa36.29■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 TOMM70O94826 608 aa36.28■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 KCNA3P22001 575 aa36.28■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 APLP1P51693 650 aa36.28■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 RFC4P35249 363 aa36.27■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa36.27■■■■□ 3.4
CKB-217ENST00000557569 FCHSD2O94868 740 aa36.26■■■■□ 3.4
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CKB-217ENST00000557569 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
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CKB-217ENST00000557569 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.24■■■■□ 3.39
CKB-217ENST00000557569 PARP3Q9Y6F1 533 aa36.24■■■■□ 3.39
CKB-217ENST00000557569 CABP4P57796 275 aa36.23■■■■□ 3.39
CKB-217ENST00000557569 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
CKB-217ENST00000557569 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
CKB-217ENST00000557569 AEBP1Q8IUX7 1158 aa36.21■■■■□ 3.39
CKB-217ENST00000557569 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
CKB-217ENST00000557569 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP36.2■■■■□ 3.39
CKB-217ENST00000557569 C9orf131Q5VYM1 1079 aa36.2■■■■□ 3.39
CKB-217ENST00000557569 CRKLP46109 303 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
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CKB-217ENST00000557569 FKBP8Q14318 412 aa36.18■■■■□ 3.38
CKB-217ENST00000557569 AMOTQ4VCS5 1084 aa36.17■■■■□ 3.38
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CKB-217ENST00000557569 PIM2Q9P1W9 311 aa36.14■■■■□ 3.38
CKB-217ENST00000557569 PANK3Q9H999 370 aa36.13■■■■□ 3.37
CKB-217ENST00000557569 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP36.12■■■■□ 3.37
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CKB-217ENST00000557569 CHRNA5P30532 468 aa36.1■■■■□ 3.37
CKB-217ENST00000557569 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
CKB-217ENST00000557569 C1orf141Q5JVX7 400 aa36.1■■■■□ 3.37
CKB-217ENST00000557569 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
CKB-217ENST00000557569 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa36.1■■■■□ 3.37
CKB-217ENST00000557569 TJP1Q07157 1748 aa36.09■■■■□ 3.37
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CKB-217ENST00000557569 WDR90Q96KV7 1748 aa36.03■■■■□ 3.36
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CKB-217ENST00000557569 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP36.02■■■■□ 3.36
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CKB-217ENST00000557569 ZPR1O75312 459 aa35.94■■■■□ 3.34
CKB-217ENST00000557569 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP35.94■■■■□ 3.34
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CKB-217ENST00000557569 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP35.93■■■■□ 3.34
CKB-217ENST00000557569 AKAP4Q5JQC9 854 aa35.93■■■■□ 3.34
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