RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557484.5

GABRA5-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit, human

TSL 5

Gene GABRA5, Length 506 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GABRA5-211	ENST00000557484	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		41.01	■■■■■ 4.16
GABRA5-211	ENST00000557484	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		41.01	■■■■■ 4.15
GABRA5-211	ENST00000557484	ATP6V1A	P38606	617 aa		41	■■■■■ 4.15
GABRA5-211	ENST00000557484	C4B	P0C0L5	1744 aa		40.99	■■■■■ 4.15
GABRA5-211	ENST00000557484	AK7	Q96M32	723 aa		40.98	■■■■■ 4.15
GABRA5-211	ENST00000557484	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	40.97	■■■■■ 4.15
GABRA5-211	ENST00000557484	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		40.97	■■■■■ 4.15
GABRA5-211	ENST00000557484	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		40.96	■■■■■ 4.15
GABRA5-211	ENST00000557484	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	40.95	■■■■■ 4.15
GABRA5-211	ENST00000557484	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		40.95	■■■■■ 4.15
GABRA5-211	ENST00000557484	ARX	Q96QS3	562 aa		40.94	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	FCHSD2	O94868	740 aa		40.93	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	POLD1	P28340	1107 aa		40.93	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	ITPK1	Q13572	414 aa		40.93	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		40.93	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	LGR6	Q9HBX8	967 aa		40.92	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	MSH5	O43196	834 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	SSFA2	P28290	1259 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	40.91	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		40.91	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	RALBP1	Q15311	655 aa		40.9	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		40.9	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	40.89	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	40.89	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		40.88	■■■■■ 4.14
GABRA5-211	ENST00000557484	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		40.88	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	MRC1	P22897	1456 aa		40.88	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		40.87	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	PRKAR2B	P31323	418 aa		40.87	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	40.86	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	MAP3K5	Q99683	1374 aa		40.86	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		40.84	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	SYT17	Q9BSW7	474 aa		40.84	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	40.83	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	40.82	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		40.82	■■■■■ 4.13
GABRA5-211	ENST00000557484	GNPAT	O15228	680 aa		40.81	■■■■■ 4.12
GABRA5-211	ENST00000557484	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		40.81	■■■■■ 4.12
GABRA5-211	ENST00000557484	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	40.79	■■■■■ 4.12
GABRA5-211	ENST00000557484	ADRA2B	P18089	450 aa		40.78	■■■■■ 4.12
GABRA5-211	ENST00000557484	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GABRA5-211	ENST00000557484	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		40.77	■■■■■ 4.12
GABRA5-211	ENST00000557484	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
GABRA5-211	ENST00000557484	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	40.76	■■■■■ 4.12
GABRA5-211	ENST00000557484	PHF14	O94880	888 aa		40.75	■■■■■ 4.11
GABRA5-211	ENST00000557484	TEF	Q10587	303 aa		40.75	■■■■■ 4.11
GABRA5-211	ENST00000557484	RPS6KA4	O75676	772 aa		40.74	■■■■■ 4.11
GABRA5-211	ENST00000557484	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		40.74	■■■■■ 4.11
GABRA5-211	ENST00000557484	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	40.74	■■■■■ 4.11
GABRA5-211	ENST00000557484	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GABRA5-211	ENST00000557484	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		40.73	■■■■■ 4.11
GABRA5-211	ENST00000557484	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	40.72	■■■■■ 4.11
GABRA5-211	ENST00000557484	NEFM	P07197	916 aa		40.72	■■■■■ 4.11
GABRA5-211	ENST00000557484	SLC39A6	Q13433	755 aa		40.69	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	MSL1	Q68DK7	614 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		40.67	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	TJP1	Q07157	1748 aa		40.64	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	SMIM5	Q71RC9	77 aa		40.64	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		40.63	■■■■■ 4.1
GABRA5-211	ENST00000557484	ZNF790	Q6PG37	636 aa		40.63	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	40.63	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	40.63	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		40.62	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		40.62	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		40.61	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	RFC4	P35249	363 aa		40.61	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	40.6	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		40.6	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	40.6	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		40.6	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	40.59	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		40.59	■■■■■ 4.09
GABRA5-211	ENST00000557484	KLHL34	Q8N239	644 aa		40.56	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	BTBD11	A6QL63	1104 aa		40.55	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	STARD3NL	O95772	234 aa		40.55	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		40.53	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		40.52	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	PRKRIP1	Q9H875	184 aa	Predicted RBP	40.52	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		40.51	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	GYS1	P13807	737 aa		40.51	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	MCM10	Q7L590	875 aa		40.51	■■■■■ 4.08
GABRA5-211	ENST00000557484	NFE2L2	Q16236	605 aa		40.5	■■■■■ 4.07
GABRA5-211	ENST00000557484	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	40.48	■■■■■ 4.07
GABRA5-211	ENST00000557484	MMP10	P09238	476 aa		40.47	■■■■■ 4.07
GABRA5-211	ENST00000557484	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	40.47	■■■■■ 4.07
GABRA5-211	ENST00000557484	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	40.46	■■■■■ 4.07
GABRA5-211	ENST00000557484	C4A	P0C0L4	1744 aa		40.46	■■■■■ 4.07
GABRA5-211	ENST00000557484	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		40.46	■■■■■ 4.07
GABRA5-211	ENST00000557484	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		40.44	■■■■■ 4.06
GABRA5-211	ENST00000557484	DCTN1	Q14203	1278 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GABRA5-211	ENST00000557484	GPR162	Q16538	588 aa		40.43	■■■■■ 4.06
GABRA5-211	ENST00000557484	PNISR	Q8TF01	805 aa	Known RBP	40.43	■■■■■ 4.06

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