RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCCD1-208	ENST00000557266	FSD2	A1L4K1	749 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RCCD1-208	ENST00000557266	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		27.89	■■■□□ 2.06
RCCD1-208	ENST00000557266	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		27.89	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	CASC1	Q6TDU7	716 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	C14orf37	Q86TY3	774 aa		27.88	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	PDE1A	P54750	535 aa		27.87	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	GNAI3	P08754	354 aa		27.86	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	GBP4	Q96PP9	640 aa		27.85	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	NFAT5	O94916	1531 aa		27.84	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	LTN1	O94822	1766 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	IP6K1	Q92551	441 aa		27.83	■■■□□ 2.05
RCCD1-208	ENST00000557266	ATP8B2	P98198	1209 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		27.82	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	REC8	O95072	547 aa		27.81	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	27.8	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	ARX	Q96QS3	562 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		27.8	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	ERC2	O15083	957 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	NBPF4	Q96M43	638 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	CACNA1F	O60840	1977 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	SSFA2	P28290	1259 aa		27.79	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	USP44	Q9H0E7	712 aa		27.78	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	PROSER2	Q86WR7	435 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
RCCD1-208	ENST00000557266	MX1	P20591	662 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		27.75	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	LGR6	Q9HBX8	967 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		27.74	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	27.73	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	PSME1	Q06323	249 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	PTMS	P20962	102 aa		27.73	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		27.72	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	ST18	O60284	1047 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	PANK2	Q9BZ23	570 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	STAP2	Q9UGK3	403 aa		27.71	■■■□□ 2.03
RCCD1-208	ENST00000557266	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		27.7	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	PHRF1	Q9P1Y6	1649 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	TMEM94	Q12767	1356 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	MRE11	P49959	708 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	SSH3	Q8TE77	659 aa		27.69	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	LRRC59	Q96AG4	307 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	HOXB7	P09629	217 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	27.68	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	C19orf44	Q9H6X5	657 aa		27.68	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	KCNQ3	O43525	872 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		27.67	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	CHML	P26374	656 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	DCC	P43146	1447 aa		27.66	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	NUCB2	P80303	420 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	POLA2	Q14181	598 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	XIRP1	Q702N8	1843 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		27.65	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	AOX1	Q06278	1338 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	PKP1	Q13835	747 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	RILPL2	Q969X0	211 aa		27.64	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.02
RCCD1-208	ENST00000557266	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		27.64	■■■□□ 2.01
RCCD1-208	ENST00000557266	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		27.64	■■■□□ 2.01
RCCD1-208	ENST00000557266	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		27.64	■■■□□ 2.01
RCCD1-208	ENST00000557266	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		27.64	■■■□□ 2.01
RCCD1-208	ENST00000557266	BEND3	Q5T5X7	828 aa		27.63	■■■□□ 2.01
RCCD1-208	ENST00000557266	BTBD11	A6QL63	1104 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RCCD1-208	ENST00000557266	TEF	Q10587	303 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RCCD1-208	ENST00000557266	NCAPD2	Q15021	1401 aa		27.62	■■■□□ 2.01
RCCD1-208	ENST00000557266	GC	P02774	474 aa		27.62	■■■□□ 2.01

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