RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553961.1

ACTN1-AS1-202, ACTN1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ACTN1-AS1, Length 599 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LINC00116Q8NCU8 138 aa18.49■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 QSER1Q2KHR3 1735 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C5P01031 1676 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 HMOX1P09601 288 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AKAP4Q5JQC9 854 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TRAPPC3LQ5T215 181 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KDRP35968 1356 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ITPK1Q13572 414 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 C4BP0C0L5 1744 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GRIN3BO60391 1043 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CFAP53Q96M91 514 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ITGB4P16144 1822 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NLGN2Q8NFZ4 835 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ADRA2BP18089 450 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RFC4P35249 363 aa18.42■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SMIM5Q71RC9 77 aa18.41■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 AMIGO3Q86WK7 504 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NLGN1Q8N2Q7 840 aa18.4■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa18.39■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UTRNP46939 3433 aa18.39■□□□□ 0.54
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLC52A2Q9HAB3 445 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NUDCQ9Y266 331 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa18.39■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RPS6KA4O75676 772 aa18.38■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MMP10P09238 476 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLC4A9Q96Q91 983 aa18.37■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RNMTO43148 476 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GAS2L2Q8NHY3 880 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 LGR6Q9HBX8 967 aa18.36■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CRKLP46109 303 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TTC5Q8N0Z6 440 aa18.35■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TEFQ10587 303 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PARP3Q9Y6F1 533 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.34■□□□□ 0.53
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.33■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GNAT3A8MTJ3 354 aa18.32■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZPR1O75312 459 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SLC39A6Q13433 755 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 UBR3Q6ZT12 1888 aa18.31■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NEFMP07197 916 aa18.3■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.3■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.3■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 STARD3NLO95772 234 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GYS1P13807 737 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TGFB2P61812 414 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DNAJC10Q8IXB1 793 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 VSIG10Q8N0Z9 540 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 WWC3Q9ULE0 1092 aa18.29■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PPP2R1AP30153 589 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PRKAR2BP31323 418 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF831Q5JPB2 1677 aa18.28■□□□□ 0.52
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FCHSD2O94868 740 aa18.25■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.24■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CHD4Q14839 1912 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SCN11AQ9UI33 1791 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 MRC1P22897 1456 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A0A0G2JLW4 131 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BTBD11A6QL63 1104 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CANXP27824 592 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FKBP8Q14318 412 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF790Q6PG37 636 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 IL17REQ8NFR9 667 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 FMNL2Q96PY5 1086 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 BCS1LQ9Y276 419 aa18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 A0A087WZG4 1122 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 USPL1Q5W0Q7 1092 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 PHACTR3Q96KR7 559 aa18.22■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 NARFQ9UHQ1 456 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa18.21■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 DPEP1P16444 411 aa18.2■□□□□ 0.5
ACTN1-AS1-202ENST00000553961 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
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