RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 KCNA3P22001 575 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 RRAGCQ9HB90 399 aa19.43■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.42■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 SBF1O95248 1867 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 NEUROD1Q13562 356 aa19.4■□□□□ 0.7
CS-230ENST00000551968 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.4■□□□□ 0.7
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CS-230ENST00000551968 INSRP06213 1382 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 ATP6V1AP38606 617 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 GGNBP2Q9H3C7 697 aa19.38■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 SLC4A9Q96Q91 983 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 RNF181Q9P0P0 153 aa19.37■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 FYB1O15117 783 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 TMF1P82094 1093 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 DCAF5Q96JK2 942 aa19.36■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 KDM2BQ8NHM5 1336 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 GYS1P13807 737 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP19.35■□□□□ 0.69
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CS-230ENST00000551968 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.35■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 KDRP35968 1356 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 TRAPPC3LQ5T215 181 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 NLGN1Q8N2Q7 840 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 SMC1BQ8NDV3 1235 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 TMOD3Q9NYL9 352 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 NCAPD2Q15021 1401 aa19.34■□□□□ 0.69
CS-230ENST00000551968 TESK2Q96S53 571 aa19.33■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 FLT4P35916 1363 aa19.32■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 KIF20BQ96Q89 1820 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 PIM2Q9P1W9 311 aa19.31■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 SLC34A2O95436 690 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 CHRNA5P30532 468 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 PARP3Q9Y6F1 533 aa19.3■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 RASSF7Q02833 373 aa19.29■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.29■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 DDR1Q08345 913 aa19.28■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 PHKG2P15735 406 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 SPG7Q9UQ90 795 aa19.27■□□□□ 0.68
CS-230ENST00000551968 RFC4P35249 363 aa19.26■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 RPS6KA4O75676 772 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 FKBP8Q14318 412 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 TIAM2Q8IVF5 1701 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa19.25■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 KIF24Q5T7B8 1368 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 ADRA2BP18089 450 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 EYA1Q99502 592 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa19.24■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 TONSLQ96HA7 1378 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 POTECB2RU33 542 aa19.23■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.22■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 IFNL2Q8IZJ0 200 aa19.22■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 GLTPD2A6NH11 291 aa19.21■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP19.21■□□□□ 0.67
CS-230ENST00000551968 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP19.21■□□□□ 0.672e-6■■□□□ 11.9
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CS-230ENST00000551968 FOXN1O15353 648 aa19.19■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.19■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 TJP1Q07157 1748 aa19.19■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.18■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 CARD14Q9BXL6 1004 aa19.17■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP19.17■□□□□ 0.66
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CS-230ENST00000551968 TM4SF1P30408 202 aa19.16■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 CRKLP46109 303 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
CS-230ENST00000551968 WASHC2AQ641Q2 1341 aa19.15■□□□□ 0.66
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CS-230ENST00000551968 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
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CS-230ENST00000551968 POTEJP0CG39 1038 aa19.14■□□□□ 0.65
CS-230ENST00000551968 NRXN2Q9P2S2 1712 aa19.13■□□□□ 0.65
CS-230ENST00000551968 CREBZFQ9NS37 354 aa19.12■□□□□ 0.65
CS-230ENST00000551968 USPL1Q5W0Q7 1092 aa19.11■□□□□ 0.65
CS-230ENST00000551968 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
CS-230ENST00000551968 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
CS-230ENST00000551968 FAM161AQ3B820 660 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-230ENST00000551968 PRDM10Q9NQV6 1147 aa19.1■□□□□ 0.65
CS-230ENST00000551968 CNTNAP1P78357 1384 aa19.09■□□□□ 0.65
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