RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 FLIIQ13045 1269 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 AAMPQ13685 434 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 WDR17Q8IZU2 1322 aa10.64□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 ABCC4O15439 1325 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 MEGF6O75095 1541 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 CHPF2Q9P2E5 772 aa10.63□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 MEIS3Q99687 375 aa10.62□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 PTPRCP08575 1304 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 RGPD5Q99666 1765 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 BABAM1Q9NWV8 329 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 UBAP1LF5GYI3 381 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 APBB1O00213 710 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 IL2RBP14784 551 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 CABP4P57796 275 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 ZNF790Q6PG37 636 aa10.61□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 TOM1O60784 492 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 TTC5Q8N0Z6 440 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 DCAF5Q96JK2 942 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 LNPKQ9C0E8 428 aa10.6□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 A0A0G2JS52 829 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 PROSER3Q2NL68 480 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 BACH2Q9BYV9 841 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.712e-6■■□□□ 11.9
CS-215ENST00000549143 MYL6BP14649 208 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 NCAPD2Q15021 1401 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 ANKRD45Q5TZF3 282 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.59□□□□□ -0.71
CS-215ENST00000549143 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.58□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 RGS12O14924 1447 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 CCT4P50991 539 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 USP16Q9Y5T5 823 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 FAM161AQ3B820 660 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 SMC5Q8IY18 1101 aa10.56□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 HOXB7P09629 217 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 C8orf34Q49A92 452 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 COL18A1P39060 1754 aa10.55□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 CEP85Q6P2H3 762 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 CHD1LQ86WJ1 897 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 DNAAF4Q8WXU2 420 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 FMNL2Q96PY5 1086 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 LTBP4Q8N2S1 1624 aa10.54□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 GNAI2P04899 355 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 CHMP4AQ9BY43 222 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 NUCB1Q02818 461 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 USP44Q9H0E7 712 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 KAT6BQ8WYB5 2073 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 GCC1Q96CN9 775 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 ARXQ96QS3 562 aa10.53□□□□□ -0.72
CS-215ENST00000549143 LRRC37A3O60309 1634 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 EXOC5O00471 708 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 COPS6Q7L5N1 327 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 C8orf37Q96NL8 207 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 GNAI3P08754 354 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 MYT1Q01538 1121 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 XAGE3Q8WTP9 111 aa10.52□□□□□ -0.73
CS-215ENST00000549143 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms