RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547541.1

TARBP2-208, Transcript of TARBP2, RISC loading complex RNA binding subunit, human

TSL 3

Gene TARBP2, Length 430 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARBP2-208	ENST00000547541	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	PANK1	Q8TE04	598 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	STRN4	Q9NRL3	753 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	COG6	Q9Y2V7	657 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	PARP4	Q9UKK3	1724 aa	Known RBP	12.87	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	PTPRC	P08575	1304 aa		12.87	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	CYP27B1	O15528	508 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		12.86	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	KRT24	Q2M2I5	525 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	STK31	Q9BXU1	1019 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC4A2	P04920	1241 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	RLBP1	P12271	317 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TARBP2-208	ENST00000547541	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	MRC1	P22897	1456 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	ABCC4	O15439	1325 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	DISP2	A7MBM2	1401 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	CABP4	P57796	275 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF790	Q6PG37	636 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	EXOC5	O00471	708 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	ADAMTS2	O95450	1211 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	TNN	Q9UQP3	1299 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	SLIT2	O94813	1529 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		12.8	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	KCNQ3	O43525	872 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		12.79	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	CACNA1F	O60840	1977 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		12.78	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	NRAP	Q86VF7	1730 aa		12.77	□□□□□ -0.36
TARBP2-208	ENST00000547541	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	12.77	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	FLII	Q13045	1269 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	USP35	Q9P2H5	1018 aa		12.77	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	12.76	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	VPS72	Q15906	364 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	NGLY1	Q96IV0	654 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	HYPK	Q9NX55	129 aa		12.76	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	RGS12	O14924	1447 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	12.75	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	G2E3	Q7L622	706 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	12.75	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		12.75	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	LRP6	O75581	1613 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	ERBB4	Q15303	1308 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	SLC39A6	Q13433	755 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	DDB1	Q16531	1140 aa		12.74	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	12.74	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	TNS2	Q63HR2	1409 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	IGHD	P01880	384 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	12.73	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		12.73	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	12.72	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	NECTIN2	Q92692	538 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	C8orf37	Q96NL8	207 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		12.72	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	12.71	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	USP21	Q9UK80	565 aa		12.71	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	12.71	□□□□□ -0.37
TARBP2-208	ENST00000547541	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	12.7	□□□□□ -0.38

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.7 ms