RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545663.5

CLSTN3-216, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 533 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-216ENST00000545663 TMF1P82094 1093 aa22.03■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 FAM161AQ3B820 660 aa22.03■■□□□ 1.12
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CLSTN3-216ENST00000545663 CCDC87Q9NVE4 849 aa22.02■■□□□ 1.12
CLSTN3-216ENST00000545663 PIM2Q9P1W9 311 aa22.02■■□□□ 1.12
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CLSTN3-216ENST00000545663 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CLSTN3-216ENST00000545663 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CLSTN3-216ENST00000545663 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.01■■□□□ 1.11
CLSTN3-216ENST00000545663 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
CLSTN3-216ENST00000545663 A0A1W2PP64 1363 aa22■■□□□ 1.11
CLSTN3-216ENST00000545663 ATP6V1AP38606 617 aa22■■□□□ 1.11
CLSTN3-216ENST00000545663 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
CLSTN3-216ENST00000545663 ITGB4P16144 1822 aa22■■□□□ 1.11
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CLSTN3-216ENST00000545663 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.99■■□□□ 1.11
CLSTN3-216ENST00000545663 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
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CLSTN3-216ENST00000545663 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.97■■□□□ 1.11
CLSTN3-216ENST00000545663 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.97■■□□□ 1.11
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CLSTN3-216ENST00000545663 SLC4A9Q96Q91 983 aa21.91■■□□□ 1.1
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CLSTN3-216ENST00000545663 RTL1A6NKG5 1358 aa21.89■■□□□ 1.1
CLSTN3-216ENST00000545663 RFC4P35249 363 aa21.89■■□□□ 1.09
CLSTN3-216ENST00000545663 CREBZFQ9NS37 354 aa21.89■■□□□ 1.09
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CLSTN3-216ENST00000545663 ADRA2BP18089 450 aa21.84■■□□□ 1.09
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CLSTN3-216ENST00000545663 GGNBP2Q9H3C7 697 aa21.82■■□□□ 1.08
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CLSTN3-216ENST00000545663 SPG7Q9UQ90 795 aa21.81■■□□□ 1.08
CLSTN3-216ENST00000545663 WBP1LQ9NX94 342 aa21.8■■□□□ 1.08
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CLSTN3-216ENST00000545663 FYB1O15117 783 aa21.79■■□□□ 1.08
CLSTN3-216ENST00000545663 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.79■■□□□ 1.08
CLSTN3-216ENST00000545663 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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CLSTN3-216ENST00000545663 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
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CLSTN3-216ENST00000545663 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CLSTN3-216ENST00000545663 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.75■■□□□ 1.07
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CLSTN3-216ENST00000545663 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.74■■□□□ 1.07
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CLSTN3-216ENST00000545663 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
CLSTN3-216ENST00000545663 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa21.72■■□□□ 1.07
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CLSTN3-216ENST00000545663 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
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CLSTN3-216ENST00000545663 NEUROD1Q13562 356 aa21.7■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 TTLL6Q8N841 843 aa21.7■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 NCAPD2Q15021 1401 aa21.7■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 DDNO94850 711 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 EYA1Q99502 592 aa21.69■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 TMEM88BA6NKF7 163 aa21.68■■□□□ 1.06
CLSTN3-216ENST00000545663 ERFEQ4G0M1 354 aa21.68■■□□□ 1.06
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