RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543656.1

RUSC1-AS1-204, RUSC1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RUSC1-AS1, Length 1,357 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NUDCQ9Y266 331 aa22.74■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PALLDQ8WX93 1383 aa22.73■■□□□ 1.23
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.73■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.72■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SMIM5Q71RC9 77 aa22.72■■□□□ 1.23
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.72■■□□□ 1.23
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NBPF4Q96M43 638 aa22.7■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ITGB4P16144 1822 aa22.67■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.67■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.67■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AK7Q96M32 723 aa22.67■■□□□ 1.22
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 EYA1Q99502 592 aa22.66■■□□□ 1.22
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.63■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FCHSD2O94868 740 aa22.63■■□□□ 1.21
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TOMM70O94826 608 aa22.62■■□□□ 1.21
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TATP17735 454 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CYP27B1O15528 508 aa22.6■■□□□ 1.21
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.6■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.59■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.59■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SSFA2P28290 1259 aa22.58■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.58■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.58■■□□□ 1.21
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.57■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 HTRA3P83110 453 aa22.56■■□□□ 1.2
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.54■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.53■■□□□ 1.2
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CAPN15O75808 1086 aa22.53■■□□□ 1.2
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 SIK1P57059 783 aa22.53■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 RUNDC1Q96C34 613 aa22.53■■□□□ 1.2
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.52■■□□□ 1.2
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ITPK1Q13572 414 aa22.51■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.5■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KLRG1Q96E93 195 aa22.5■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 C10orf71Q711Q0 1435 aa22.5■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PRKAR2BP31323 418 aa22.5■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TGFB2P61812 414 aa22.49■■□□□ 1.19
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
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RUSC1-AS1-204ENST00000543656 JMYQ8N9B5 988 aa22.48■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.48■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ATP6V1AP38606 617 aa22.47■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 C4AP0C0L4 1744 aa22.46■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 DPEP1P16444 411 aa22.46■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.46■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NGEFQ8N5V2 710 aa22.46■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.46■■□□□ 1.19
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.45■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.45■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.45■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 KCPQ6ZWJ8 1503 aa22.44■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.44■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TNS4Q8IZW8 715 aa22.43■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.42■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 APAF1O14727 1248 aa22.41■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 FSTL1Q12841 308 aa22.41■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.41■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 ATG3Q9NT62 314 aa22.41■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 NFE2L2Q16236 605 aa22.4■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
RUSC1-AS1-204ENST00000543656 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.4■■□□□ 1.18
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